Objective: Identify molecular mimicry between TPO, eosinophil peroxidase (EPX), thyroglobulin and IL24 and microorganism antigens.
Methods: Through in silico analysis, we performed local alignments between human and microorganism antigens with PSI-BLAST. Proteins that did not present a 3D structure were modeled by homology through the Swiss Modeller server and epitope prediction was performed through Ellipro. Epitopes were located in the 3D models using PYMOL software.
Results: A total of 38 microorganism antigens (parasites, bacteria) had identities between 30% and 45%, being the highest with Anisakis simplex. The alignment between 2 candidate proteins from A. simplex and EPX presented significant values, with identities of 43 and 44%. In bacteria, Campylobacter jejuni presented the highest identity with thyroglobulin (35%). 220 linear and conformational epitopes of microorganism antigens were predicted. Peroxidasin-like proteins from Toxocara canis and Trichinella pseudospiralis presented 10 epitopes similar to TPO and EPX, as possible molecules triggering cross-reactivity. No virus presented identity with the human proteins studied.
Conclusion: TPO and EPX antigens shared potential cross-reactive epitopes with bacterial and nematode proteins, suggesting that molecular mimicry could be a mechanism that explains the relationship between infections and urticaria/hypothyroidism. In vitro work is needed to demonstrate the results obtained in the in silico analysis.
Objetivo: Identificar mimetismo molecular entre TPO, eosinofil peroxidasa (EPX), tiroglobulina e IL24 y antígenos de microorganismos.
Métodos: A través de análisis in silico, realizamos los alineamientos locales entre los antígenos humanos y de microorganismos con PSI-BLAST. Las proteínas que no presentaban estructura 3D, fueron modeladas por homología a través del servidor Swiss Modeller y se realizó una predicción de epítopes a través de Ellipro. Los epítopes se localizaron en los modelos 3D utilizando el software PYMOL.
Resultados: Un total de 38 antígenos de microorganismos (parásitos y bacterias), tuvieron identidades entre 30 y 45%, siendo los más altos con Anisakis simplex. El alineamiento entre dos proteínas candidatas de A. simplex y EPX presentaron valores importantes, con identidades de 43 y 44%. En las bacterias, Campylobacter jejuni presentó la mayor identidad con tiroglobulina (35%). Se predijeron 220 epítopes lineales y conformacionales de antígenos de microorganismos. Las proteínas similares a la peroxidasina de Toxocara canis y Trichinella pseudospiralis presentaron diez epítopes similares a TPO y EPX, como posibles moléculas desencadenantes de una reactividad cruzada. Ningún virus presentó identidad con las proteínas humanas estudiadas.
Conclusión: Los antígenos TPO y EPX compartieron potenciales epítopes de reacción cruzada con proteínas bacterianas y nematodos, lo que sugiere que el mimetismo molecular podría ser un mecanismo que explique la relación entre infecciones y la urticaria/hipotiroidismo. Se necesitan trabajos in vitro que demuestren los resultados obtenidos en el análisis in silico.
Keywords: Autoimmune diseases; Molecular mimicry; Thyroid disease; Urticaria.