Microbiota of Chickens and Their Environment in Commercial Production

Avian Dis. 2023 Mar;67(1):1-9. doi: 10.1637/aviandiseases-D-22-00048.

Abstract

Chickens in commercial production are subjected to constant interaction with their environment, including the exchange of microbiota. In this review, we therefore focused on microbiota composition in different niches along the whole line of chicken production. We included a comparison of microbiota of intact eggshells, eggshell waste from hatcheries, bedding, drinking water, feed, litter, poultry house air and chicken skin, trachea, crop, small intestine, and cecum. Such a comparison showed the most frequent interactions and allowed for the identification of microbiota members that are the most characteristic for each type of sample as well as those that are the most widespread in chicken production. Not surprisingly, Escherichia coli was the most widely distributed species in chicken production, although its dominance was in the external aerobic environment and not in the intestinal tract. Other broadly distributed species included Ruminococcus torque, Clostridium disporicum, and different Lactobacillus species. The consequence and meaning of these and other observations are evaluated and discussed.

Estudio recapitulativo- Microbiota de pollos y su entorno en producción comercial. Los pollos en producción comercial están sujetos a una interacción constante con su entorno, incluido el intercambio de microbiota. Esta revisión, por lo tanto, se enfoca en la composición de la microbiota en diferentes nichos a lo largo de toda la línea de producción de pollos. Se incluye una comparación de microbiota de cascarones de huevo intactos, desechos de cascarones de huevos de plantas de incubación, cama, agua potable, alimento, cama, aire de gallinero y piel de pollo, tráquea, buche, intestino delgado y ciego. Tal comparación mostró las interacciones más frecuentes y permitió identificar los miembros de la microbiota más característicos para cada tipo de muestra, así como los más extendidos en la producción de pollos. No en vano, Escherichia. coli fue la especie más ampliamente distribuida en la producción de pollos, aunque su dominio fue en el ambiente aeróbico externo y no en el tracto intestinal. Otras especies ampliamente distribuidas incluyeron Ruminococcus torque, Clostridium disporicum y diferentes especies de Lactobacillus. Se evalúan y discuten la consecuencia y el significado de estas y otras observaciones.

Keywords: bedding; cecum; chicken; crop; environment; feed; litter; microbiota.

Publication types

  • Review
  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Animals
  • Cecum
  • Chickens
  • Escherichia coli
  • Microbiota*
  • Poultry
  • Poultry Diseases*
  • RNA, Ribosomal, 16S

Substances

  • RNA, Ribosomal, 16S