Colorectal cancer. Genetic variants in BMP signaling pathway and ancestry in the Mexican population

Gac Med Mex. 2022;158(6):410-415. doi: 10.24875/GMM.M22000720.

Abstract

Introduction: Genetic variants related to bone morphogenetic proteins (BMP2, BMP4, GREM1, SMAD7) signaling pathway have been associated with colorectal cancer, mainly in Caucasian populations.

Objective: To describe the association of variants in members of the BMP signaling pathway in a Mexican population, characterized by its indigenous American and Caucasian ancestry.

Methods: Genotyping of 1,000 colorectal cancer cases and 1,043 control individuals recruited in Mexico City, Monterrey, and Torreón was carried out using the Sequenom platform. Associations between colorectal cancer and variants were studied with univariate and multivariate analyses.

Results: Variants rs4444235, rs12953717 and rs4939827 replicated the association with the neoplasm (p ≤ 0.05). Caucasian ancestry showed association with the tumor.

Conclusions: The study replicated the associations between colorectal cancer and SMAD7 and BMP4 variants, with an association being observed with the Caucasian component of the ethnic mix.

Introducción: Variantes génicas relacionadas con la vía de señalización de las proteínas morfogenéticas óseas (BMP2, BMP4, GREM1, SMAD7) se han asociado a cáncer colorrectal, principalmente en poblaciones caucásicas.

Objetivo: Describir la asociación de variantes en miembros de la vía BMP en población mexicana, caracterizada por su ancestría indoamericana y caucásica.

Métodos: Se realizó el genotipado de 1000 casos de cáncer colorrectal y 1043 individuos de control reclutados en la Ciudad de México, Monterrey y Torreón mediante la plataforma Sequenom. Con análisis univariados y multivariados se estudiaron las asociaciones entre cáncer colorrectal y variantes.

Resultados: Las variantes rs4444235, rs12953717 y rs4939827 replicaron la asociación con la neoplasia (p ≤ 0.05). La ascendencia caucásica mostró asociación con el tumor.

Conclusiones: El estudio mostró las asociaciones entre cáncer colorrectal y las variantes SMAD7 y BMP4, así como con el componente caucásico de la mezcla étnica.

Keywords: Association study; Bone morphogenetic proteins; Colorectal cancer; Cáncer colorrectal; Estudio de asociación; Mexico; México; Polimorfismos de nucleótido simple; Proteínas morfogenéticas óseas; Single-nucleotide polymorphisms.

MeSH terms

  • Bone Morphogenetic Proteins* / genetics
  • Case-Control Studies
  • Colorectal Neoplasms* / epidemiology
  • Colorectal Neoplasms* / genetics
  • Genetic Predisposition to Disease*
  • Genome-Wide Association Study
  • Humans
  • Mexico
  • Polymorphism, Single Nucleotide
  • Signal Transduction

Substances

  • Bone Morphogenetic Proteins