Legionella quinlivanii strain isolated from a human: A case report and whole genome sequencing analysis

J Assoc Med Microbiol Infect Dis Can. 2020 Jun 23;5(2):112-114. doi: 10.3138/jammi-2019-0021. eCollection 2020 Jun.

Abstract
in English, French

We describe a strain of Legionella quinlivanii isolated from a bronchoalveolar lavage specimen from an 83-year-old patient in the province of Québec. Identification was done using 16S rRNA sequencing. The strain could replicate efficiently in human THP-1 macrophages and maintained a low level of cytotoxicity. Upon analyzing the whole genome sequencing data, the icm/dot secretion system was present, but the strain lacked some effector genes known to express proteins toxic to cells. The pathogenicity of this Legionella species should be investigated further.

Les auteurs décrivent une souche de Legionella quinlivanii isolée dans le prélèvement de lavage bronchoalvéolaire d’une patiente de 83 ans de la province de Québec. Ils ont identifié la souche par séquençage de l’ARN ribosomal 16S. Cette souche, qui pouvait se répliquer en toute efficacité dans les macrophages humains THP-1, maintenait une faible cytotoxicité. L’analyse des données de séquençage complet du génome de la souche a révélé la présence du système de sécrétion icm/dot, mais l’absence de certains gènes effecteurs connus pour exprimer les protéines cytotoxiques. Il faudra étudier plus en profondeur la pathogénicité de cette espèce de Legionella.

Keywords: Legionella quinlivanii; bronchoalveolar lavage; cytotoxicity; whole genome sequencing.

Publication types

  • Case Reports

Grants and funding

This study was conducted with Laboratoire de santé publique du Québec (LSPQ) internal funding. Dr Faucher is holding a team research project grant (188813) from Fonds de recherche du Québec–Nature et technologies, and a Discovery Grant from Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (418289-2012).