1 Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Laboratoire associé au Centre National de Référence des virus des infections respiratoires, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France; CIRI, Centre International de Recherche en Infectiologie, Team VirPath, Univ Lyon, Inserm, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France; GenEPII Sequencing Platform, Institut des Agents Infectieux, Hospices Civils de Lyon, F-69004, Lyon, France. Electronic address: antonin.bal@chu-lyon.fr.
2 Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Laboratoire associé au Centre National de Référence des virus des infections respiratoires, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France; CIRI, Centre International de Recherche en Infectiologie, Team VirPath, Univ Lyon, Inserm, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France; GenEPII Sequencing Platform, Institut des Agents Infectieux, Hospices Civils de Lyon, F-69004, Lyon, France.
3 Dyomédéa-BIOGROUP - Plateau technique de la Sauvegarde, Lyon, France.
4 Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Laboratoire associé au Centre National de Référence des virus des infections respiratoires, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France; CIRI, Centre International de Recherche en Infectiologie, Team VirPath, Univ Lyon, Inserm, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France.