Observational study on antimicrobial resistance in Escherichia coli and Salmonella isolates from Ontario calf samples submitted to a diagnostic laboratory from 2007 to 2020

Can Vet J. 2022 Mar;63(3):260-268.

Abstract

The objectives of this study were to i) describe Escherichia coli and Salmonella isolates; ii) investigate the temporal trends in antimicrobial resistance (AMR) profiles; and iii) evaluate the impact of season and age on these AMR profiles from diagnostic and post-mortem samples in Ontario calves ≤ 2-months-old submitted from 2007 to 2020 to the Animal Health Laboratory in Guelph, Ontario, Canada. Antimicrobial susceptibility testing results were measured by the Kirby-Bauer disk diffusion method. A total of 1291 isolates with AMR profiles were obtained from calves, with E. coli (n = 434) and Salmonella (n = 378) being the most common bacteria characterized for AMR. For E. coli, 79% of isolates tested showed a positive result in F5/K99, whereas for Salmonella isolates, S. Typhimurium (33%) and S. Dublin (22%) were the 2 most common serotypes identified. Multivariable logistic regression models were built to evaluate AMR profiles for E. coli (n = 414) and Salmonella (n = 357) to each antimicrobial tested. Most E. coli isolates (91%) and Salmonella isolates (97%) were resistant to at least one of the antimicrobials tested. In general, E. coli and Salmonella had higher odds of resistance in calves aged ≥ 2 wk compared to 1-week-old calves, and little difference was seen in the level of resistance over the years observed or between seasons in most of the antimicrobials tested. Prospective research should investigate potential risk factors for the development of AMR in calves examples being antimicrobial use and farm management practices.

Étude observationnelle sur la résistance aux antimicrobiens d’isolats d’Escherichia coli et de Salmonella provenant d’échantillons de veaux de l’Ontario soumis à un laboratoire de diagnostic de 2007 à 2020. Les objectifs de cette étude étaient de i) décrire les isolats d’Escherichia coli et de Salmonella; ii) étudier les tendances temporelles des profils de résistance aux antimicrobiens (RAM); et iii) évaluer l’impact de la saison et de l’âge sur ces profils de RAM à partir d’échantillons diagnostiques et post-mortem de veaux de l’Ontario âgés de ≤ 2 mois soumis de 2007 à 2020 au Laboratoire de santé animale de Guelph, Ontario, Canada. Les résultats des tests de sensibilité aux antimicrobiens ont été mesurés par la méthode de diffusion en disque de Kirby-Bauer. Un total de 1291 isolats avec des profils de RAM ont été obtenus à partir de veaux, E. coli (n = 434) et Salmonella (n = 378) étant les bactéries les plus courantes caractérisées pour la RAM. Pour E. coli, 79 % des isolats testés ont montré un résultat positif en F5/K99, alors que pour les isolats de Salmonella, S. Typhimurium (33 %) et S. Dublin (22 %) étaient les deux sérotypes les plus fréquemment identifiés. Des modèles de régression logistique multivariable ont été construits pour évaluer les profils de RAM pour E. coli (n = 414) et Salmonella (n = 357) pour chaque antimicrobien testé. La plupart des isolats d’E. coli (91 %) et des isolats de Salmonella (97 %) étaient résistants à au moins un des antimicrobiens testés. En général, E. coli et Salmonella présentaient un risque de résistance plus élevé chez les veaux âgés de ≥ 2 semaines par rapport aux veaux âgés d’une semaine, et peu de différence a été observée dans le niveau de résistance au cours des années observées ou entre les saisons pour la plupart des antimicrobiens testés. La recherche prospective devrait étudier les facteurs de risque potentiels pour le développement de la RAM chez les veaux, par exemple l’utilisation d’antimicrobiens et les pratiques de gestion de la ferme.(Traduit par Dr Serge Messier).

Publication types

  • Observational Study, Veterinary
  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Animals
  • Anti-Bacterial Agents / pharmacology
  • Cattle
  • Cattle Diseases* / epidemiology
  • Drug Resistance, Bacterial
  • Escherichia coli
  • Escherichia coli Infections* / drug therapy
  • Escherichia coli Infections* / epidemiology
  • Escherichia coli Infections* / veterinary
  • Feces / microbiology
  • Microbial Sensitivity Tests / veterinary
  • Ontario / epidemiology
  • Prospective Studies
  • Salmonella

Substances

  • Anti-Bacterial Agents