The gene Sr38 for bread wheat breeding in Western Siberia

Vavilovskii Zhurnal Genet Selektsii. 2021 Nov;25(7):740-745. doi: 10.18699/VJ21.084.

Abstract

Present-day wheat breeding for immunity exploits extensively closely related species from the family Triticeae as gene donors. The 2NS/2AS translocation has been introduced into the genome of the cultivated cereal Triticum aestivum from the wild relative T. ventricosum. It contains the Lr37, Yr17, and Sr38 genes, which support seedling resistance to the pathogens Puccinia triticina Eriks., P. striiformis West. f. sp. tritici, and P. graminis Pers. f. sp. tritici Eriks. & E. Henn, which cause brown, yellow, and stem rust of wheat, respectively. This translocation is present in the varieties Trident, Madsen, and Rendezvous grown worldwide and in the Russian varieties Morozko, Svarog, Graf, Marquis, and Homer bred in southern regions. However, the Sr38 gene has not yet been introduced into commercial varieties in West Siberia; thus, it remains of practical importance for breeding in areas where populations of P. graminis f. sp. tritici are represented by avirulent clones. The main goal of this work was to analyze the frequency of clones (a)virulent to the Sr38 gene in an extended West Siberian collection of stem rust agent isolates. In 2019-2020, 139 single pustule isolates of P. graminis f. sp. tritici were obtained on seedlings of the standard susceptible cultivar Khakasskaya in an environmentally controlled laboratory (Institute of Cytology and Genetics SB RAS) from samples of urediniospores collected on commercial and experimental bread wheat f ields in the Novosibirsk, Omsk, Altai, and Krasnoyarsk regions. By inoculating test wheat genotypes carrying Sr38 (VPM1 and Trident), variations in the purity of (a)virulent clones were detected in geographical samples of P. graminis f. sp. tritici. In general, clones avirulent to Sr38 constitute 60 % of the West Siberian fungus population, whereas not a single virulent isolate was detected in the Krasnoyarsk collection. The Russian breeding material was screened for sources of the stem rust resistance gene by using molecular markers specif ic to the 2NS/2AS translocation. A collection of hybrid lines and varieties of bread spring wheat adapted to West Siberia (Omsk SAU) was analyzed to identify accessions promising for the region. The presence of the gene was postulated by genotyping with specif ic primers (VENTRIUP-LN2) and phytopathological tests with avirulent clones of the fungus. Dominant Sr38 alleles were identif ied in Lutescens 12-18, Lutescens 81-17, Lutescens 66-16, Erythrospermum 79/07, 9-31, and 8-26. On the grounds of the composition of the West Siberian P. graminis f. sp. tritici population, the Sr38 gene can be considered a candidate for pyramiding genotypes promising for the Novosibirsk, Altai, and Krasnoyarsk regions.

Современная селекция пшеницы на иммунитет широко применяет генетический резерв близкородственных видов из семейства Triticeae. Транслокация 2NS/2AS привнесена в геном культурного злака Triticum aestivum от дикорастущего сородича T. ventricosum и содержит гены Lr37, Yr17 и Sr38, которые отвечают за устойчивость пшеницы на уровне проростков к бурой, желтой и стеблевой ржавчине с соответствующими возбудителями: Puccinia triticina Eriks., P. striiformis West. f. sp. tritici и P. graminis Pers. f. sp. tritici Eriks. & E. Henn. Данная транслокация известна в таких мировых сортах, как Trident, Madsen, Rendezvous, а также в отечественных сортах южной селекции Морозко, Сварог, Граф, Маркиз и Гомер. При этом ген Sr38 до сих пор не введен в производственные сорта, высеваемые на территории Западной Сибири, поэтому сохраняет практическое значение для селекции на иммунитет в областях, где патогенная популяция P. graminis f. sp. tritici представлена авирулентными клонами. Основная цель работы состояла в анализе частоты а/вирулентных клонов к гену Sr38 в расширенной западносибирской выборке возбудителя стеблевой ржавчины. В лаборатории с контролируемым климатом (Институт цитологии и генетики СО РАН) на проростках универсального восприимчивого сорта Хакасская выделено 139 монопустульных изолятов P. graminis f. sp. tritici из образцов урединиоспор Новосибирской, Омской областей, Алтайского и Красноярского края, собранных в 2019–2020 гг. на производственных и селекционных посевах мягкой пшеницы. Путем заражения тестерных генотипов пшеницы, несущих ген Sr38 (VPM1 и Trident), выявлены вариации по частоте а/вирулентных клонов в географических образцах P. graminis f. sp. tritici. В целом текущая западносибирская популяция представлена на 60 % авирулентными клонами гриба к гену Sr38, при этом в образцах популяции из Красноярского края не выявлено ни одного вирулентного изолята. Поиск источников гена устойчивости к стеблевой ржавчине среди отечественного селекционного материала был выполнен с помощью специфических молекулярных маркеров на транслокацию 2NS/2AS. Исходя из перспективы использования в регионе, выбор проводили среди коллекции линий и сортов мягкой яровой пшеницы Омского ГАУ, адаптированных к условиям Западной Сибири. Присутствие гена постулировалось путем проведения процедуры генотипирования с помощью специфических праймеров (VENTRIUP-LN2) и фитопатологического тестирования авирулентными клонами гриба. Носителями доминантных аллелей гена Sr38 оказались линии Лютесценс 12-18, Лютесценс 81-17, Лютесценс 66-16, Эритроспермум 79/07, 9-31 и 8-26. Полученные данные по составу образцов западносибирской популяции P. graminis f. sp. tritici позволяют рассматривать ген Sr38 в качестве кандидата для включения в селекцию пшеницы в Красноярском крае, а также в составе генных пирамид в Новосибирской области и Алтайском крае.

Keywords: Puccinia graminis f. sp. tritici; Sr38; Triticum aestivum; avirulent clones; resistance.