Alpha thalassemia (α-thalassemia) is an autosomal recessive disorder due to the reduction or absence of α globin chain production. Laboratory diagnosis of α-thalassemia requires molecular analysis for the confirmatory diagnosis. A screening test, comprising complete blood count, blood smear and hemoglobin quantification by high performance liquid chromatography and capillary electrophoresis, may not possibly detect all the thalassemia diseases. This review focused on the molecular techniques used to detect α-thalassemia, and the advantages and disadvantages of each technique were highlighted. Multiplex gap-polymerase chain reaction, single-tube multiplex polymerase chain reaction, multiplex ligation-dependent probe amplification, and loop-mediated isothermal amplification were used to detect common deletion of α-thalassemia. Furthermore, the reverse dot blot analysis and a single tube multiplex polymerase chain reaction could detect non-deletion mutation of the α-globin gene. Sanger sequencing is widely used to detect non-deletion mutations of α-thalassemia. Recently, next-generation sequencing was introduced in the diagnosis of both deletion and point mutations of α-thalassemia. Despite the advantages and disadvantages of different techniques, the routine method employed in the laboratory should be based on the facility, expertise, available equipment, and economic conditions.
Alfa talasemi (α-talasemi), α globin zincir üretiminin azalması ya da yokluğu nedeniyle otozomal resesif geçişli bir hastalıktır. α-talaseminin laboratuvar tanısı, doğrulayıcı tanı için moleküler analiz gerektirmektedir. Yüksek performanslı sıvı kromatografisi ve kapiler elektroforez ile tam kan sayımı, kan yayması ve hemoglobin ölçümü içeren bir tarama testi, muhtemelen tüm talasemi hastalıklarını tespit edemeyebilir. Bu derleme, α-talasemiyi saptamak için kullanılan moleküler tekniklere odaklanmış ve her tekniğin avantaj ve dezavantajları vurgulanmıştır. Ortak α-talasemi silinmesini saptamak için multipleks boşluk-polimeraz zincir reaksiyonu, tek tüplü multipleks polimeraz zincir reaksiyonu, multipleks ligasyona bağlı prob amplifikasyonu ve loop aracılı izotermal amplifikasyon kullanıldı. Ayrıca, ters nokta leke analizi ve tek tüplü multipleks polimeraz zincir reaksiyonu, α-globin geninin delesyon olmayan mutasyonunu tespit edebilir. Sanger dizilimi, α-talaseminin delesyon olmayan mutasyonlarını saptamak için yaygın olarak kullanılmaktadır. Son zamanlarda, α-talaseminin hem delesyon hem de nokta mutasyonlarının tanısında yeni nesil dizileme tanıtılmıştır. Farklı tekniklerin avantaj ve dezavantajları olmasına rağmen, laboratuvarda uygulanan rutin yöntemler tesise, uzmanlığa, mevcut ekipmana ve ekonomik koşullara dayanmalıdır.
Keywords: Alpha chain; deletion; molecular techniques; non-deletion; thalassemia.
© Copyright Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine.