OBJECTIVES: To assess the performance of the GenoType MTBDRsl v1, a line-probe assay (LPA), to exclude baseline resistance to fluoroquinolones (FQs) and second-line injectables (SLIs) in the Standard Treatment Regimen of Anti-tuberculosis Drugs for Patients With MDR-TB 1 (STREAM 1) trial.METHODS: Direct sputum MTBDRsl results in the site laboratories were compared to indirect phenotypic drug susceptibility testing (pDST) results in the central laboratory, with DNA sequencing as a reference standard.RESULTS: Of 413 multidrug-resistant TB (MDR-TB) patients tested using MTBDRsl and pDST, 389 (94.2%) were FQ-susceptible and 7 (1.7%) FQ-resistant, while 17 (4.1%) had an inconclusive MTBDRsl result. For SLI, 372 (90.1%) were susceptible, 5 (1.2%) resistant and 36 (8.7%) inconclusive. There were 9 (2.3%) FQ discordant pDST/MTBDRsl results, of which 3 revealed a mutation and 5 (1.3%) SLI discordant pDST/MTBDRsl results, none of which were mutants on sequencing. Among the 17 FQ- and SLI MTBDRsl-inconclusive samples, sequencing showed 1 FQ- and zero SLI-resistant results, similar to frequencies among the conclusive MTBDRsl. The majority of inconclusive MTBDRsl results were associated with low bacillary load samples (acid-fast bacilli smear-negative or scantily positive) compared to conclusive results (P < 0.001).CONCLUSION: MTBDRsl can facilitate the rapid exclusion of FQ and SLI resistances for enrolment in clinical trials.
Objectifs: Dans cette étude, nous avons évalué l’aptitude du test Genotype® MTBDRsl v1.0, un essai de la sonde linéaire (LPA), à exclure la résistance initiale aux fluoroquinolones (FQ) et aux médicaments injectables de seconde intention (SLI) dans le cadre de l’essai STREAM 1.
Méthodes: Les résultats de l’examen direct des expectorations par le test MTBDRsl réalisé dans les laboratoires des sites ont été comparés aux résultats des tests indirects phénotypiques de sensibilité aux médicaments (pDST) réalisés au laboratoire central, avec séquençage de l’ADN comme norme de référence.
Résultats: Sur 413 patients atteints de TB multirésistante (MDR-TB) testés par MTBDRsl et pDST, 389 (94,2%) présentaient une TB sensible aux FQ et sept (1,7%) une TB résistante aux FQ, alors que le résultat du test MTBDRsl de 17 (4,1%) patients n’était pas concluant. Pour les SLI, 372 (90,1%) patients étaient sensibles, cinq (1,2%) étaient résistants et 36 (8,7%) patients présentaient des résultats non concluants. Neuf (2,3%) résultats de sensibilité aux FQ par tests pDST/MTBDRsl étaient discordants, dont trois révélaient une mutation. Cinq (1,3%) résultats de sensibilité aux SLI par tests pDST/ MTBDRsl étaient discordants, mais aucune mutation n’a été détectée par séquençage. Parmi les 17 échantillons non concluants pour la détection des résistances aux FQ et SLI par tests MTBDRsl, le séquençage a mis en évidence un résultat de résistance aux FQ et aucune résistance aux SLI; ces chiffres sont similaires aux fréquences observées parmi les résultats concluants des tests MTBDRsl. La majorité des resultats non concluants aux tests MTBDRsl ont été associés à des échantillons à faibles charges bacillaires (frottis negatifs ou faiblement positifs pour la recherche de bacilles acido-alcoolo-résistants) par rapport aux résultats concluants (P < 0,001).
conclusion: Le test MTBDRsl peut faciliter l’exclusion rapide des résistances aux FQ et SLI dans le cadre d’une inclusion dans un essai clinique.