Microbiological and molecular characterization of antimicrobial resistance in uropathogenic Escherichia coli from peruvian public hospitals
Rev Peru Med Exp Salud Publica. 2021 Jan-Mar;38(1):119-123.
doi: 10.17843/rpmesp.2021.381.6182.
Epub 2021 Jun 25.
[Article in
Spanish,
English]
Authors
Pool Marcos-Carbajal
1
2
, Guillermo Salvatierra
2
, José Yareta
1
, Jimena Pino
3
, Nancy Vásquez
3
, Pilar Diaz
4
, Isabel Martínez
5
, Percy Asmat
6
, Carlos Peralta
7
, Caridad Huamani
7
, Alexander Briones
8
, Manuel Ruiz
9
, Nicomedes Laura
10
, Álvaro Luque
11
, Leonel Arapa
12
, Pablo Tsukayama
2
Affiliations
- 1 Laboratorio de Investigación en Biología Molecular, EP Medicina Humana, Universidad Peruana Unión, Lima, Perú.
- 2 Laboratorio de Genómica Microbiana, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú.
- 3 Laboratorio de Microbiología, Hospital Antonio Lorena, Cuzco, Perú.
- 4 Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional Salud Pública San Martín, Tarapoto, Perú.
- 5 Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional de Salud Pública Tumbes, Tumbes, Perú.
- 6 Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional Salud Pública, La Libertad, Trujillo, Perú.
- 7 Área de Microbiología, IPRESS Jorge Chávez, Madre de Dios, Perú.
- 8 Servicio de Microbiología, Hospital Regional de Loreto, Iquitos, Perú.
- 9 Área de Microbiología, Clínica Adventista Ana Stahl, Iquitos, Perú.
- 10 Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional de Salud Pública Huancavelica, Huancavelica, Perú.
- 11 Área de Microbiología, Clínica Americana Juliaca, Juliaca, Perú.
- 12 Laboratorio de Microbiología, Hospital Carlos Monge Medrano, Juliaca, Perú.
We characterized the antimicrobial resistance of 70 Escherichia coli isolates obtained from patients with a urinary tract infection (UTI) from 8 public hospitals in Peru. Resistance profiles were identified using the automated MicroScan® system. A standard polymerase chain reaction was used for the detection of the bla TEM, bla CTX-M, bla SHV and bla PER genes. The 65.7% (46/70) of the isolates presented a multidrug-resistant phenotype and 55.7% (39/70) were extended-spectrum beta-lactamases producers. High levels of resistance were detected for ampicillin (77,1%), ciprofloxacin (74,3%), trimethoprim/sulfamethoxazole (62,9%), cefepime (57,1%), and cefuroxime (57,1%). The bla TEM gene was the most frequent (31,4%), followed by bla CTX-M (18,6%) and bla SHV (2,9%) genes. These results show high resistance levels to antimicrobials of clinical use in E. coli isolates from hospital UTI patients in Peru.
Se caracterizó la resistencia antimicrobiana de 70 aislados de Escherichia coli obtenidos de pacientes con infección del tracto urinario (ITU) provenientes de ocho hospitales públicos en el Perú. Los perfiles de resistencia fueron identificados mediante el uso del sistema automatizado MicroScan®. Se utilizó una reacción en cadena de la polimerasa convencional para la detección de los genes bla TEM, bla CTX-M, bla SHV y bla PER. El 65,7% (46/70) de los aislados presentó un fenotipo multidrogorresistente y el 55,7% (39/70) fue identificado como productores de betalactamasas de espectro extendido. Se detectaron altos niveles de resistencia para ampicilina (77,1%), ciprofloxacina (74,3%), trimetoprim/sulfametoxazol (62,9%), cefepime (57,1%) y cefuroxima (57,1%). El gen bla TEM fue el más frecuente con un 31,4%, seguido por bla CTX-M (18,6%) y bla SHV (2,9%). Los resultados evidencian altos niveles de resistencia a antimicrobianos de importancia clínica en aislados de E. coli de pacientes con ITU en el Perú.
MeSH terms
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Anti-Bacterial Agents / pharmacology
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Drug Resistance, Bacterial / genetics
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Escherichia coli Infections* / drug therapy
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Hospitals, Public
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Humans
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Microbial Sensitivity Tests
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Peru
-
Uropathogenic Escherichia coli* / genetics
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beta-Lactamases / genetics
Substances
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Anti-Bacterial Agents
-
beta-Lactamases