Identification of TB space-time clusters and hotspots in Ouest département, Haiti, 2011-2016

Public Health Action. 2021 Jun 21;11(2):101-107. doi: 10.5588/pha.20.0085.

Abstract

Background: Haiti has the highest incidence rate of TB in the Western Hemisphere, with an estimated 170 cases per 100,000 in 2019. Since 2010, control efforts have focused on targeted case-finding activities in urban areas, implementation of rapid molecular diagnostics at high-volume TB centers, and improved reporting. TB analyses are rarely focused on lower geographic units; thus, the major goal was to determine if there were focal areas of TB transmission from 2011 to 2016 at operational geographic levels useful for the National TB Control Program (PNLT).

Methods: We created a geocoder to locate TB cases at the smallest geographic level. Kulldorff's space-time permutation scan, Anselin Moran's I, and Getis-Ord Gi* statistics were used to determine the spatial distribution and clusters of TB.

Results: With 91% of cases linked using the geocoder, TB clusters were identified each year. Getis-Ord Gi* analysis revealed 14 distinct spatial clusters of high incidences in the Port-au-Prince metropolitan area. One hundred retrospective space-time clusters were detected.

Conclusion: Our study confirms the presence of TB hotspots in the Ouest département, with most clusters in the Port-au-Prince metropolitan area. Results will help the PNLT and its partners better design case-finding strategies for these areas.

Contexte: Haïti a le taux d’incidence le plus élevé de TB de l’hémisphère Ouest avec un nombre de cas estimé à 170 par 100 000 en 2019. Depuis 2010, les efforts de contrôle se sont focalisés sur des activités de recherche ciblée des cas dans les zones urbaines, la mise en œuvre de diagnostic moléculaire rapide dans des centres TB de grand volume et de meilleurs rapports. Les analyses TB sont rarement focalisées sur les unités géographiques; le but principal était de déterminer s’il existait des zones focales de transmission de la TB de 2011 à 2016 à des niveaux géographiques opérationnels utiles pour le Programme national de Lutte contre la TB (PNLT).

Méthodes: Nous avons créé géocodeur pour localiser les cas de TB au plus petit niveau géographique. Le scan de permutation espace-temps de Kulldorff’s, Anselin Moran’s I et les statistiques de Getis-Ord Gi* ont été utilisés pour déterminer la distribution spatiale et les clusters de TB.

Résultats: Avec 91% des cas liés avec le géocodeur, les clusters de TB ont été identifiés chaque année. L’analyse Getis-Ord Gi* a révélé 14 clusters spatiaux distincts d’incidence élevée dans la zone métropolitaine de Port-au-Prince. Cent clusters rétrospectifs espacetemps ont été détectés.

Conclusion: Notre étude confirme la présence de hotspots TB dans la département Ouest, la majorité des clusters étant situés dans la zone métropolitaine de Port-au-Prince. Les résultats aideront le PNLT et ses partenaires à mieux affiner leurs stratégies de recherche des cas dans ces zones.

Keywords: Anselin Moran’s I; Geocoder; Getis-Ord Gi*; space-time scan.