Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil

Carolina M Voloch; Ronaldo da Silva Francisco Jr; Luiz G P de Almeida; Cynthia C Cardoso; Otavio J Brustolini; Alexandra L Gerber; Ana Paula de C Guimarães; Diana Mariani; Raissa Mirella da Costa; Orlando C Ferreira Jr; Covid19-UFRJ Workgroup, LNCC Workgroup, Adriana Cony Cavalcanti; Thiago Silva Frauches; Claudia Maria Braga de Mello; Isabela de Carvalho Leitão; Rafael Mello Galliez; Débora Souza Faffe; Terezinha M P P Castiñeiras; Amilcar Tanuri; Ana Tereza R de Vasconcelos

doi:10.1128/JVI.00119-21

Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil

J Virol. 2021 Apr 26;95(10):e00119-21. doi: 10.1128/JVI.00119-21. Epub 2021 Mar 1.

Authors

Carolina M Voloch¹, Ronaldo da Silva Francisco Jr², Luiz G P de Almeida², Cynthia C Cardoso¹, Otavio J Brustolini², Alexandra L Gerber², Ana Paula de C Guimarães², Diana Mariani¹, Raissa Mirella da Costa¹, Orlando C Ferreira Jr¹; Covid19-UFRJ Workgroup, LNCC Workgroup, Adriana Cony Cavalcanti; Thiago Silva Frauches³, Claudia Maria Braga de Mello⁴, Isabela de Carvalho Leitão⁵, Rafael Mello Galliez⁶, Débora Souza Faffe⁵, Terezinha M P P Castiñeiras⁶, Amilcar Tanuri⁷, Ana Tereza R de Vasconcelos⁸

Affiliations

¹ Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
² Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil.
³ Secretaria Municipal de Saúde de Maricá, Maricá, Brazil.
⁴ Secretaria Estadual de Saúde do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
⁵ Instituto de Biofísica, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
⁶ Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
⁷ Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil atrv@lncc.br atanuri1@gmail.com.
⁸ Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil atrv@lncc.br atanuri1@gmail.com.

Abstract

Almost simultaneously, several studies reported the emergence of novel SARS-CoV-2 lineages characterized by their phylogenetic and genetic distinction (1), (2), (3), (4).….

Publication types

Letter