Analysis of the complete organellar genomes of the economically valuable kelp Lessonia spicata (Lessoniaceae, Phaeophyceae) from Chile

Daniel Tineo; Karol B Rubio; Jegnes B Melendez; Jani E Mendoza; Jhonsy O Silva; Jhordy Perez; Eggleantina E Esquerre; Melissa Perez-Alania; Samia L Fernandez; Smith E Aguilar; Fernando Chuquizuta; Yadira M Olano; Renzo P Hoyos; Jaris E Veneros; Ligia M Garcia; Natalia Arakaki; Enrique Garcia-Candela; Manuel Oliva; Andres Mansilla; Martha S Calderon; Jeffery R Hughey; Danilo E Bustamante

doi:10.1080/23802359.2019.1640647

Analysis of the complete organellar genomes of the economically valuable kelp Lessonia spicata (Lessoniaceae, Phaeophyceae) from Chile

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Jul 16;4(2):2581-2582. doi: 10.1080/23802359.2019.1640647.

Authors

Daniel Tineo¹, Karol B Rubio¹, Jegnes B Melendez¹, Jani E Mendoza¹, Jhonsy O Silva¹, Jhordy Perez¹, Eggleantina E Esquerre¹, Melissa Perez-Alania², Samia L Fernandez¹, Smith E Aguilar³, Fernando Chuquizuta³, Yadira M Olano³, Renzo P Hoyos³, Jaris E Veneros⁴, Ligia M Garcia⁵, Natalia Arakaki⁶, Enrique Garcia-Candela⁷, Manuel Oliva¹, Andres Mansilla⁷, Martha S Calderon^{1

8}, Jeffery R Hughey⁹, Danilo E Bustamante¹

Affiliations

¹ Instituto de Investigación para el Desarrollo Sustentable de Ceja de Selva (INDES-CES), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Amazonas, Peru.
² Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Agraria La Molina, Lima, Peru.
³ Facultad Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología (FIZAB), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Amazonas, Peru.
⁴ Facultad de Ingeniería Civil y Ambiental (FICIAM), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Amazonas, Peru.
⁵ Facultad de Ingeniería y Ciencias Agrarias (FICA), Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza, Amazonas, Peru.
⁶ Banco de Germoplasma de Organismos Acuáticos, Instituto del Mar del Perú, Callao, Peru.
⁷ Instituto Tecnológico de la Producción, CITEacuícola Ahuashiyacu, San Martin, Peru.
⁸ Laboratorio de Ecosistemas Marinos Antárticos y Sub-antárticos (LEMAS), Universidad de Magallanes, Punta Arenas, Chile.
⁹ Division of Mathematics, Science, and Engineering, Hartnell College, Salinas, CA, USA.

Abstract

Lessonia spicata (Suhr) Santelices is the most ecologically and economically important kelp from Pacific South America. Here, we contribute to the bioinformatics and evolutionary systematics of the species by performing high throughput sequencing on L. spicata from Valparaiso, Chile. The L. spicata complete mitogenome is 37,097 base pairs (bp) in length and contains 66 genes (GenBank accession MK965907), the complete plastid genome is 130,305 bp and has 173 genes (accession MK965908), and the data assembled 7,630 bp of the nuclear ribosomal cistron (accession MK965909). The organellar genomes are similar in structure and content to others published from the Laminariales.

Keywords: Chile; Lessonia; kelp; mitogenome; plastid genome.