Clinical impact of rapid viral respiratory panel testing on pediatric critical care of patients with acute lower respiratory infection

Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed). 2020 Oct 8:S0213-005X(20)30285-8. doi: 10.1016/j.eimc.2020.08.017. Online ahead of print.
[Article in English, Spanish]

Abstract

Background: We aimed to determine the impact of utilizing a rapid panel test of respiratory viral and atypical bacteria (FilmArray® Respiratory Panel, FA RP) on etiological diagnosis of acute lower respiratory infection (ALRI) and antimicrobial stewardship in critical care pediatric patients.

Methods: Prospective cohort study of patients aged<18 years with clinical diagnosis of ALRI that were admitted to the Pediatric Intensive Care Unit (PICU) of Hospital Sant Joan de Deu (Barcelona, Spain) during December 2015-February 2017. Patients were diagnosed by FA RP and by a bundle of routine microbiological assays.

Results: ALRI viral and bacterial etiology was confirmed by a composite reference standard of routine microbiological assays in 72 (55.4%) and 15 (11.5%) respiratory samples, respectively, that were collected from 130 children (median age, 3.5 months, IQR 1.1-14.8 months; 54.6% male). Comparatively, FA RP use increased etiological confirmation of ALRI in up to 123 (94.6%) samples (p<0.001) but only determined a bacterial origin in 2 (1.5%). Availability of diagnostic results before patient discharge from the PICU rose from 65.4 to 38.5% (p<0.001). Use of the new panel test directly influenced antimicrobial stewardship in 11 (8.4%) episodes, leading to discontinuation of antiviral drugs (n=5), administration of targeted antibiotics (n=3), antiviral therapy start (n=2) and both targeted antibiotic administration and discontinuation of antiviral drugs (n=1).

Conclusion: FA RP contributed to improve etiological diagnosis of ALRI in a timely manner while enhancing a more rational use of antimicrobial drugs in critical care pediatric patients.

Antecedentes: Nuestro objetivo fue determinar el impacto de la utilización de una prueba rápida de detección múltiple de virus y bacterias atípicas respiratorias (FilmArray® Respiratory Panel [FA RP]) en el diagnóstico etiológico de la infección respiratoria aguda de vías bajas (IRAVB) y en la administración de antimicrobianos en pacientes críticos pediátricos.

Métodos: Estudio de una cohorte prospectiva de pacientes < 18 años con diagnóstico clínico de IRAVB que ingresaron en la Unidad de Cuidados Intensivos Pediátricos (UCIP) del Hospital Sant Joan de Deu, Barcelona, España, durante diciembre de 2015-febrero de 2017. Los pacientes fueron diagnosticados por FA RP y por un grupo de pruebas microbiológicas de rutina.

Resultados: Las pruebas microbiológicas de rutina confirmaron la etiología viral y bacteriana de la IRAVB en 72 (55,4%) y 15 (11,5%) muestras respiratorias, respectivamente, obtenidas de 130 niños (edad mediana: 3,5 meses; rango intercuartil: 1,1-14,8 meses; 54,6% varones). Comparativamente, el uso de FA RP aumentó la confirmación etiológica de la IRAVB en hasta 123 (94,6%) muestras (p < 0,001), pero solo determinó un origen bacteriano en 2 (1,5%). La disponibilidad de resultados diagnósticos antes del alta del paciente de la UCIP aumentó del 38,5 al 65,4% (p < 0,001). El uso de la nueva prueba de detección múltiple influyó directamente en la administración de antimicrobianos en 11 (8,4%) episodios, orientando la interrupción de tratamientos antivirales (n = 5), la administración de antibióticos dirigidos (n = 3), el inicio de terapias antivirales (n = 2) y la administración dirigida de antibióticos e interrupción simultánea de tratamiento antiviral (n = 1).

Conclusión: FA RP contribuyó a mejorar y agilizar el diagnóstico etiológico de la IRAVB, facilitando un uso más racional de antimicrobianos en pacientes críticos pediátricos.

Keywords: Acute lower respiratory infection; Antimicrobial; Antimicrobiano; Infección respiratoria aguda de vías bajas; Pediatric Intensive Care Unit; Polymerase chain reaction; Prueba de detección múltiple de virus respiratorios; Reacción en cadena de la polimerasa; Unidad de cuidados intensivos pediátricos; Viral respiratory panel.