Epidemiology of SARS-CoV-2 in Egypt

East Mediterr Health J. 2020 Jul 23;26(7):768-773. doi: 10.26719/emhj.20.084.

Abstract

Background: On 30 January 2020, the World Health Organization declared the novel severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 to be a Public Health Emergency of International Concern. Egypt is among the five countries reporting the highest number of cases in Africa.

Aims: We aimed to provide an overview of the epidemic features of COVID-19 in Egypt in order to help guide an effective lockdown-exit strategy.

Methods: The incidence proportions, case fatality rates (CFR), growth rates, doubling time (Td), basic reproductive number (R0) and Herd Immunity Threshold (HIT) were calculated weekly and reviewed.

Results: As of 21 May 2020, the epidemic growth rate and R0 have decreased significantly; the averages (±SD) were 0.35 (±0.33) and 2.6 (±1.55) respectively. However, the incidence proportion has increased to 14 cases /100 000 population.

Conclusion: COVID-19 transmissibility has declined but the incidence rate has increased, underscoring that any lockdown-exit strategy should include measures to strengthen physical distancing, and case-based interventions to prevent an uncontrolled upsurge of COVID-19 cases.

الخصائص الوبائية لفيروس كورونا سارس–2 في مصر.

غادة نصر رضوان.

الخلفية: في 30 يناير/ كانون الثاني 2020، أعلنت منظمة الصحة العالمية أن فيروس كورونا المستجد المسبب للمتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة–2 طارِئة صحية عامة تسبب قلقاً دولياً. ومصر من ضمن البلدان الخمسة التي أبلغت عن أكبر عدد من حالات الإصابة في أفريقيا.

الأهداف: هدفت هذه الدراسة إلى تقديم نبذة عامة عن الخصائص الوبائية لمرض كوفيد–19 في مصر من أجل المساعدة على توجيه استراتيجية فعالة للخروج من الحظر.

طرق البحث: حُسِبت نسب الإصابات، ومعدلات الوفيات بين الحالات، ومعدلات الزيادة، وزمن التضاعف، وعدد التكاثر الأساسي، والحد الأدنى للمناعة الجماعية أسبوعياً وجرت مراجعتها.

النتائج: منذ 21 مايو / أيار 2020، انخفض بشدة معدل زيادة الوباء وعدد التكاثر الأساسي، فكان متوسطهما 0.35 (0.33±)و2.6 (1.55±) على التوالي. ورغم ذلك، زادت نسبة الإصابة إلى 14 حالة لكل 000 100 نسمة.

الاستنتاج: تراجعت سراية مرض كوفيد–19 لكن معدل الإصابة به ازداد، مما يشدد على ضرورة اشتمال أي استراتيجية لحظر الخروج على تدابير لتعزيز التباعد البدني، والتدخلات المستندة إلى الحالات لمنع أي ارتفاع مفاجئ خارج عن السيطرة لحالات كوفيد–19.

Épidémiologie du SARS-CoV-2 en Égypte.

Contexte: Le 30 janvier 2020, l’Organisation mondiale de la Santé a déclaré que le nouveau coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère constituait une urgence de santé publique de portée internationale. L’Égypte figure parmi les cinq pays notifiant le plus grand nombre de cas en Afrique.

Objectifs: Nous avions pour objectif de fournir un aperçu des caractéristiques épidémiques de la maladie à coronavirus (COVID-19) en Égypte afin d’aider à orienter une stratégie efficace de confinement-déconfinement.

Méthodes: Les chiffres de l’incidence, les taux de létalité, les taux de croissance, le temps de doublement, le taux de reproduction de base (R0) et le seuil d’immunité collective ont été calculés et revus chaque semaine.

Résultats: Au 21 mai 2020, le taux de croissance épidémique et le R0 ont nettement diminué ; les moyennes (±ET) étaient respectivement de 0,35 (±0,33) et de 2,6 (±1,55). Toutefois, l’incidence a augmenté, passant à 14 cas pour 100 000 habitants.

Conclusion: La transmissibilité de la COVID-19 a diminué mais l’incidence a augmenté, soulignant que toute stratégie de confinement-déconfinement devrait inclure des mesures pour renforcer la distanciation physique et des interventions basées sur les cas pour prévenir une recrudescence non contrôlée des cas de COVID-19.

Keywords: COVID-19; basic reproductive number; case fatality rate; doubling time; epidemic growth rate.

MeSH terms

  • Betacoronavirus
  • COVID-19
  • Coronavirus Infections / epidemiology*
  • Egypt / epidemiology
  • Humans
  • Incidence
  • Pandemics
  • Pneumonia, Viral / epidemiology*
  • Quarantine
  • SARS-CoV-2