Performance of Eastern Mediterranean Region laboratories in the World Health Organization external quality assessment programme for arbovirus diagnostics

East Mediterr Health J. 2020 May 21;26(5):616-619. doi: 10.26719/emhj.20.015.

Abstract

Background: Arboviruses such as dengue virus, yellow fever virus, Zika virus and chikungunya virus are major threats to human health globally, including countries in the Eastern Mediterranean Region (EMR).

Aims: This study aimed to assess laboratory proficiency in EMR countries for detection of dengue virus, yellow fever virus, Zika virus and chikungunya virus.

Methods: A global external quality assessment programme for arbovirus diagnostics was developed and run in 2016 and 2018. National-level public health laboratories were instructed to apply the polymerase chain reaction detection method on specimen panels containing dengue virus, yellow fever virus, Zika virus and chikungunya virus.

Results: Over both rounds of the programme, 100% of participating EMR laboratories correctly detected yellow fever virus and chikungunya virus, ≥ 84.6% detected dengue fever virus and ≥ 76.9% detected Zika virus.

Conclusion: While participating EMR countries demonstrated good proficiency in detecting arboviruses, only half of them were enrolled in the global external quality assessment programme, providing an incomplete picture of regional capacity. Effort should be put into increasing participation in subsequent rounds.

أداء مختبرات إقليم شرق المتوسط في برنامج تقييم الجودة الخارجي لمنظمة الصحة العالمية لتشخيص الفيروسات المنقولة بالمفصليات.

رينال سكويرز، كريستوفر أوكسنفورد، سيباستيان كوجنات، فرانك كونينجس.

الخلفية: تشكل الفيروسات المنقولة بالمفصليات مثل فيروس حمى الضنك، وفيروس الحمى الصفراء، وفيروس زيكا، وفيروس الشيكونجونيا، تهديدات رئيسية لصحة الإنسان على الصعيد العالمي بما في ذلك بلدان إقليم شرق المتوسط.

الأهداف: هدفت هذه الدراسة إلى تقييم الكفاءة المختبرية في بلدان إقليم شرق المتوسط للكشف عن فيروس حمى الضنك وفيروس الحمى الصفراء وفيروس زيكا وفيروس الشيكونجونيا.

طرق البحث: أُعد ونُفذ برنامج عالمي لتقييم الجودة الخارجية لتشخيص الفيروسات المنقولة بالمفصليات في عامي 2016 و 2018. وصدرت تعليمات إلى مختبرات الصحة العامة على الصعيد الوطني بتطبيق طريقة التفاعل السلسي للبوليميراز (PCR) على مجموعة عينات تحتوي على فيروس حمى الضنك، وفيروس الحمى الصفراء، وفيروس زيكا، وفيروس الشيكونجونيا.

النتائج: خلال جولتي البرنامج العالمي اكتشفت المختبرات المشاركة في التقييم فيروس الحمى الصفراء وفيروس الشيكونجونيا اكتشافًا صحيحًا بنسبة %100، واكتشفت فيروس حمى الضنك بنسبة أكبر من أو يساوي %84.6، واكتشفت فيروس زيكا بنسبة %76.9.

الاستنتاج: برغم أن بلدان إقليم شرق المتوسط المشاركة أظهرت إتقانًا جيدًا في الكشف عن الفيروسات المنقولة بالمفصليات، فقد سُجِّل نصفها فقط في برنامج تقييم الجودة الخارجية العالمي، وهذا يعرض صورة غير مكتملة لقدرات الإقليم. وينبغي بذل الجهود لزيادة المشاركة في الجولات التالية.

Performance des laboratoires de la Région de la Méditerranée orientale dans le cadre du programme d’évaluation externe de la qualité de l’Organisation mondiale de la Santé en matière de diagnostic des arbovirus.

Contexte: Les arbovirus tels que le virus de la dengue, le virus de la fièvre jaune, le virus Zika et le virus chikungunya constituent des menaces majeures pour la santé humaine dans le monde, y compris dans les pays de la Région de la Méditerranée orientale.

Objectifs: La présente étude visait à évaluer l’aptitude des laboratoires dans les pays de la Région pour la détection des virus susmentionnés.

Méthodes: Un programme mondial d’évaluation externe de la qualité pour le diagnostic des arbovirus a été mis au point et adopté en 2016 et 2018. Les laboratoires de santé publique nationaux ont reçu l’instruction d’appliquer la méthode de détection par amplification génique sur des panels d’échantillons de laboratoires contenant le virus de la dengue, le virus de la fièvre jaune, le virus Zika et le virus chikungunya.

Résultats: Au cours des deux cycles du programme, 100 % des laboratoires participants de la Région de la Méditerranéenne orientale ont correctement détecté le virus de la fièvre jaune et le virus du chikungunya, un pourcentage supérieur ou égal à 84,6 % ont détecté le virus de la dengue et un pourcentage supérieur ou égal à 76,9 % de ces laboratoires ont détecté le virus Zika.

Conclusions: Alors que les pays participants de la Région de la Méditerranée orientale ont démontré une bonne maîtrise de la détection des arbovirus, seulement la moitié d’entre eux étaient inscrits au programme mondial d’évaluation externe de la qualité, fournissant une image incomplète de la capacité régionale. Des efforts devraient être déployés pour accroître la participation aux cycles suivants.

Keywords: arbovirus; assessment; diagnostics; laboratory; quality.

MeSH terms

  • Arbovirus Infections / diagnosis*
  • Arboviruses*
  • Chikungunya Fever / diagnosis
  • Dengue / diagnosis
  • Humans
  • Laboratories / standards*
  • Laboratories / statistics & numerical data
  • Middle East
  • Quality Assurance, Health Care / standards*
  • Quality Assurance, Health Care / statistics & numerical data
  • World Health Organization / organization & administration
  • Yellow Fever / diagnosis
  • Zika Virus Infection* / diagnosis