Concordance analysis of three diagnostic tests for malaria in the symptomatic population of Colombian endemic municipalities

Biomedica. 2020 Mar 1;40(1):117-128. doi: 10.7705/biomedica.4893.
[Article in English, Spanish]

Abstract

Introduction: Taking into account the difficulty of performing malaria microscopic diagnosis in rural areas, rapid diagnostic tests (RDT) are a good alternative, but it is important to verify their diagnostic performance. Objective: To evaluate the diagnostic performance of the RDTs used in five Colombian departments by comparing them with the microscopic diagnosis and using PCR as the reference standard. Materials and methods: Thick blood film and RDTs were used to diagnose symptomatic individuals; additionally, the filter paper was impregnated with blood for the molecular test. Results: We included 314 samples whose percentage of positivity for malaria was 49% by PCR, 48% by microscopy and 46% by RDT; parasitemia ranged between 180 and 23,800 p/μL of blood. The concordance of the results from the microscopy units and those of the PCR (National Laboratory of Reference) was as follows: Cohen’s kappa coefficient, 0.975 (95% CI: 0.950-0.999); sensitivity, 97% (95% CI 95-100); specificity 100% (95% CI: 100-100), and kappa index of species, 0.958 (IC95%: 0.912-1.00). The concordance between the Pf/Pv RDT (at the microscopy units) and the PCR (National Laboratory of Reference) was as follows: kappa coefficient, 0.878 (95% CI: 0.784-0.973); sensitivity, 94% (95% CI: 87-100); specificity, 95% (95% CI: 90-100), and kappa index of species, 1.0 (95% CI: 1.00-1.00). The concordance between the Pf/Pan RDT versus PCR was: Cohen’s kappa coefficient, 0.920 (95 % CI: 0.865- 0.974); sensitivity, 94% (95% CI: 90-98); specificity, 99% (95% CI 95-100), and kappa index of species, 0.750 (IC95% 0,637-0,863). Conclusion: The results of this study support the use of RDTs in Colombia; however, more training of the personnel is required to accurately differentiate Plasmodium species.

Introducción. Dadas las dificultades del diagnóstico microscópico de la malaria o paludismo en las áreas rurales, las pruebas de diagnóstico rápido constituyen una buena alternativa, por lo que es importante conocer su desempeño. Objetivo. Evaluar el desempeño de las pruebas de diagnóstico rápido utilizadas en cinco departamentos para al diagnóstico microscópico de la malaria usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) como estándar de referencia. Materiales y métodos. Se usaron la prueba de gota gruesa y las pruebas de diagnóstico rápido y, además, se impregnó papel de filtro con sangre para la prueba molecular (PCR), en individuos sintomáticos. Resultados. Se incluyeron 314 muestras cuyo porcentaje de positividad para malaria fue de 49 % con la PCR, de 48 % con microscopía y de 46 % con las pruebas de diagnóstico rápido; la parasitemia fluctuó entre 180 y 23.800 parásitos/μl de sangre. La concordancia de los resultados de los puestos de microscopía comparados con la PCR (Laboratorio Nacional de Referencia) fueron los siguientes: coeficiente kappa de Cohen de 0,975 (IC95% 0,950-0,999), sensibilidad de 97 % (IC95% 95-100) y especificidad de 100 % (IC95% 100-100), e índice kappa de especie de 0,958 (IC95% 0,912-1,00). La concordancia de los resultados de la prueba de diagnóstico rápido Pf/Pv en los puestos de microscopía y los de la PCR (Laboratorio Nacional de Referencia), fue la siguiente: coeficiente kappa de 0,878 (IC95% 0,784-0,973), sensibilidad de 94 % (IC95% 87-100), especificidad de 95 % (IC95% 90-100), e índice kappa de especie de 1,0 (IC95% 1,00-1,00). La concordancia entre la prueba de diagnóstico rápido Pf/Pan y la PCR fue la siguiente: coeficiente kappa de Cohen de 0,920 (IC95% 0,865-0,974), sensibilidad de 94 % (IC95% 90-98), especificidad de 99 % (IC95% 95-100), e índice kappa de especie de 0,750 (IC95% 0,637-0,863). Conclusión. Los resultados de este estudio respaldan el uso de las pruebas de diagnóstico rápido en Colombia, aunque se requiere un mejor entrenamiento del personal para diferenciar eficientemente las especies de Plasmodium.

Keywords: Malaria/diagnosis; microscopy; polymerase chain reaction; Colombia.

Publication types

  • Comparative Study

MeSH terms

  • Chromatography, Affinity*
  • Cities
  • Colombia / epidemiology
  • Comorbidity
  • DNA, Protozoan / genetics
  • Endemic Diseases*
  • Humans
  • Malaria, Falciparum / blood
  • Malaria, Falciparum / diagnosis*
  • Malaria, Falciparum / epidemiology
  • Malaria, Falciparum / parasitology
  • Malaria, Vivax / blood
  • Malaria, Vivax / diagnosis*
  • Malaria, Vivax / epidemiology
  • Malaria, Vivax / parasitology
  • Parasitemia / blood
  • Parasitemia / diagnosis*
  • Parasitemia / epidemiology
  • Plasmodium falciparum / genetics
  • Plasmodium falciparum / isolation & purification
  • Plasmodium vivax / genetics
  • Plasmodium vivax / isolation & purification
  • Polymerase Chain Reaction*
  • Reproducibility of Results
  • Sensitivity and Specificity
  • Symptom Assessment

Substances

  • DNA, Protozoan