[Antimicrobial Susceptibility Patterns in Outpatient Urinary Tract Infection in the District of Coimbra, Portugal: A Cross-Sectional Study]

Acta Med Port. 2019 Sep 2;32(9):568-575. doi: 10.20344/amp.10862. Epub 2019 Sep 2.
[Article in Portuguese]

Abstract

Introduction: Urinary tract infections in the community setting are quite common. It is necessary to be aware of antibiotic susceptibility patterns in order to provide rational empirical therapy. The aim of this study is to determine the frequency and antimicrobial susceptibility of the strains responsible for urinary tract infections in primary health care, in the district of Coimbra, Portugal.

Material and methods: In this observational and cross-sectional study, we analyzed 7134 positive urine cultures of outpatient laboratories in the district of Coimbra, over one year. In most cases, a positive culture was defined by a threshold of 105 colony-forming units per milliliter and was conducted by the automated system VITEK® 2, by bioMérieux. We used descriptive and inferential statistics to determine the prevalence and antimicrobial susceptibility of bacteria and to ascertain whether there were differences associated with sex and age.

Results: From the total of positive cultures, 83.4% pertained to females and 41.0% to individuals over 75 years old. Escherichia coli was the most frequent strain (63.9%), although its prevalence was lower (p < 0.001) in males and individuals over 75 years old. Its susceptibility to fosfomycin and nitrofurantoin was higher than 95% and with ciprofloxacin and trimethoprim/sulfamethoxazole it was lower than 80%. Resistances were more frequent (p < 0.001) in males and in the elderly.

Discussion: Escherichia coli was the most frequent strain, revealing less resistance to fosfomycin and nitrofurantoin. Antimicrobial susceptibility was lower in the elderly and in males, populations in whom empirical therapy may be less successful.

Conclusion: In order to improve clinical results, we recommend periodic surveillance of antimicrobial susceptibility, which could enable the provision of efficient information to clinicians, namely those who prescribe empirically for such infections, as well as standardization of identification methods of bacterial strains diagnosis and of the antibiotic kits to be tested.

Introdução: As infeções do trato urinário são muito frequentes na comunidade. É essencial conhecer o padrão de sensibilidade aos antibióticos para uma terapêutica empírica racional. O objetivo deste estudo é determinar a prevalência e o perfil de suscetibilidade aos antibióticos dos microrganismos implicados em infeções urinárias a nível dos cuidados primários de saúde, no distrito de Coimbra.Material e Métodos: Neste estudo observacional e transversal, analisámos 7134 uroculturas positivas de laboratórios de ambulatório do distrito de Coimbra, no período de um ano. Na maioria dos casos, a urocultura positiva foi definida por um limiar de 105 unidadesformadoras de colónias por mililitro e executada através do sistema automatizado VITEK® 2, da bioMérieux. Usámos estatística descritiva e inferencial para determinar a prevalência e a sensibilidade aos antibióticos dos microrganismos e averiguar a relação destas com o sexo e com a idade.Resultados: Do total de uroculturas positivas, 83,4% pertencia ao sexo feminino e 41,0% pertencia à população acima dos 75 anos. A Escherichia coli foi o microrganismo mais frequente (63,9%), mas a sua prevalência foi inferior (p < 0,001) no sexo masculino e acima dos 75 anos. A sua sensibilidade à fosfomicina e à nitrofurantoína foi superior a 95% e à ciprofloxacina e ao cotrimoxazol foi inferior a 80%. As resistências foram mais frequentes (p < 0,001) no sexo masculino e nos mais idosos.Discussão: A Escherichia coli foi o microrganismo mais frequente, verificando-se menores percentagens de resistência desta à fosfomicina e à nitrofurantoína. A sensibilidade aos antibióticos foi menor em idades mais avançadas e também no sexo masculino (p < 0,001), populações onde a antibioterapia empírica pode ter maior risco de insucesso.Conclusão: Recomendamos a monitorização periódica do perfil de sensibilidade aos antibióticos, para eficaz informação aos médicos que têm de proceder a terapêutica empírica deste tipo de infeções, bem como a uniformização das técnicas de identificação das estirpes bacterianas e dos conjuntos de antibióticos a serem testados nos antibiogramas.

Keywords: Drug Resistance, Multiple, Bacterial; Portugal; Urinary Tract Infections.

Publication types

  • Observational Study

MeSH terms

  • Age Factors
  • Anti-Bacterial Agents / pharmacology*
  • Anti-Infective Agents, Urinary / pharmacology
  • Bacteriological Techniques / methods
  • Colony Count, Microbial / methods
  • Cross-Sectional Studies
  • Drug Resistance, Bacterial
  • Escherichia coli / drug effects
  • Female
  • Humans
  • Male
  • Microbial Sensitivity Tests*
  • Portugal
  • Sex Factors
  • Urinary Tract Infections / drug therapy*
  • Urinary Tract Infections / microbiology

Substances

  • Anti-Bacterial Agents
  • Anti-Infective Agents, Urinary