The Mississippi Flyway is of utmost importance in monitoring influenza A viral diversity in the natural reservoir, as it is used by approximately 40% of North American migratory waterfowl. In 2008, influenza A virus (IAV) surveillance was initiated in eight states within the flyway during annual southern migration, to gain better insight into the natural history of influenza A viruses in the natural reservoir. More than 45,000 samples have been collected and tested, resulting in hundreds of diverse influenza A viral isolates, but seasonal sampling may not be the best strategy to gain insight into the natural history of IAV. To investigate the progress of this sampling strategy toward understanding the ecology of IAV in wild waterfowl, data from mallard ducks (Anas platyrhynchos) sampled nearly year-round in Ohio were examined. Overall, 3,645 samples were collected from mallards in Ohio from 2008 to 2016, with IAV being recovered from 13.6% of all samples collected. However, when data from each month are examined individually, it becomes apparent that the aggregated summary may be providing a misleading view of IAV in Ohio mallards. For instance, in August the frequency of viral recovery is 29.8%, with isolates representing at least 47 hemagglutinin/ neuraminidase (HA/NA) combinations. In November, during the height of southern migration, IAV isolation drops to 6.2%, with only 25 HA/NA combinations being represented. Our biased sampling towards convenience and high IAV recovery has created gaps in the data set, which prohibit a full understanding of the IAV ecology in this waterfowl population.
Identificación de brechas en la vigilancia de la influenza aviar en aves acuáticas silvestres en Ohio, Estados Unidos. La ruta migratoria de Mississippi es de suma importancia para monitorear la diversidad del virus de la influenza A en los reservorios naturales, ya que es utilizada por aproximadamente el 40% de las aves acuáticas migratorias de América del Norte. En el año 2008, se inició la vigilancia del virus de la influenza A (IAV) en ocho estados dentro de dicha ruta migratoria durante la migración anual al sur, para obtener una mejor comprensión de la historia natural de los virus de la influenza A en el reservorio natural. Se han recolectado y analizado más de 45,000 muestras, lo que dio como resultado cientos de diversos aislados virales de influenza A, pero el muestreo estacional puede no ser la mejor estrategia para conocer la historia natural del virus de la influenza aviar. Para investigar el progreso de esta estrategia de muestreo para comprender la ecología del virus de la influenza aviar en aves acuáticas silvestres, se examinaron datos de patos de collar (Anas platyrhynchos) muestreados durante casi todo el año en Ohio. En total, se recolectaron 3,645 muestras de patos silvestres en Ohio desde el año 2008 hasta el 2016, y se recuperó al virus de la influenza aviar en el 13.6% de todas las muestras recolectadas. Sin embargo, cuando los datos de cada mes se examinaron individualmente, se hace evidente que el resumen agregado puede proporcionar un panorama engañoso del virus de la influenza aviar en los patos silvestres de Ohio. Por ejemplo, en agosto, la frecuencia de recuperación viral fue del 29.8%, con aislamientos que representan al menos 47 combinaciones de hemaglutininas (HA) y neuraminidasas (NA). En noviembre, durante el apogeo de la migración hacia el sur, el aislamiento del virus de la influenza se redujo a 6.2%, con solo 25 combinaciones de HA y NA representadas. El muestreo sesgado hacia la conveniencia y la alta recuperación del virus de influenza ha creado brechas en el conjunto de datos, que prohíbe una comprensión completa de. Abbreviations: HA = hemagglutinin; IAV = influenza A virus; NA = neuraminidase.
Keywords: Mississippi Migratory Flyway; influenza A virus; wild waterfowl.