Setting: Xpert® MTB/RIF is the first-line diagnostic test for Mycobacterium tuberculosis and rifampicin (RIF) resistance in South Africa.
Objective: To describe the rates of Xpert RIF resistance not confirmed on follow-up testing, as well as the patient and test characteristics associated with discordant results.
Design: Retrospective review of patients with isolates showing Xpert RIF resistance. Line-probe assay, phenotypic drug susceptibility testing or repeat Xpert were all considered confirmatory tests of RIF resistance. 'Discordance' was defined as a patient with RIF resistance identified on initial Xpert testing, with a subsequent confirmatory test indicating RIF susceptibility. Associations were analysed using Pearson χ² difference of proportions and modified Poisson regression.
Results: RIF discordance occurred in 22/263 subjects and was associated with Xpert probe B, probe binding delay, as opposed to probe dropout, and probe binding delays (ΔCt) of between 4 and 4.9.
Conclusion: Discordant RIF resistance was common in our cohort and was associated with Xpert probe delay and use of probe B.
contexte:: L’Xpert® MTB/RIF est le test diagnostique de première ligne pour Mycobacterium tuberculosis et pour la résistance à la rifampicine (RIF) en Afrique du Sud.
objectif:: Décrire les taux de résistance à la RIF par Xpert qui n’ont pas été confirmés lors des tests de suivi ainsi que les caractéristiques du patient et du test associées à ces résultats discordants.
schéma:: Revue rétrospective des patients ayant des isolats montrant une résistance à la RIF par Xpert. Le test de sonde en ligne, le test de pharmacosensibilité phénotypique ou la répétition de l’Xpert ont tous été considérés comme des tests de confirmation de la résistance à la RIF. La discordance a été; définie comme une résistance à la RIF identifiée lors de l’Xpert initial avec un test de confirmation ultérieur indiquant une sensibilité à la RIF. Les associations analysées grâce à la différence de proportion de Pearson χ2 et à la régression modifiée de Poisson.
résultats:: Une discordance relative à la RIF est survenue chez 22/263 sujets et a été; associée avec l’Xpert sonde B, retard plutôt que l’absence de fixation de la sonde, et des retards entre ΔCt 4–4.9.
conclusion:: Une discordance relative à la résistance à la RIF a été fréquente dans notre cohorte et associée avec un retard d’hybridation de la sonde Xpert et avec la sonde B.
marco de referencia:: La prueba Xpert® MTB/RIF es el método preferido de diagnóstico del Mycobacterium tuberculosis y la resistencia a rifampicina (RIF) en Suráfrica.
objetivo:: Describir las tasas de resistencia a RIF detectada con la prueba Xpert, que no se confirmó con las pruebas de seguimiento y las características de los pacientes que se asociaron con estos resultados discordantes.
método:: Se practicó un análisis retrospectivo de los pacientes con aislados que habían revelado resistencia a RIF con la prueba Xpert. Se consideraron como pruebas confirmatorias de la resistencia las pruebas con sondas en línea, las pruebas fenotípicas de sensibilidad a los medicamentos o la repetición de la prueba Xpert. Se definió la discordancia como un paciente con resistencia a RIF en la prueba Xpert inicial, cuyas pruebas confirmatorias posteriores revelaron sensibilidad a RIF. Al analizar las asociaciones se utilizó) la prueba χ2 de Pearson para las diferencias de proporciones y la regresión de Poisson modificada.
resultados:: Se observó discordancia con respecto ala resistencia a RIF en 22 de 263 personas; la discordancia se asoció con la sonda B de la prueba Xpert, un retraso de hibridación de la sonda más que una ausencia de hibridación, y retrasos con respecto al umbral ΔCt de 4 a 4,9.
conclusion:: La discordancia con respecto a la resistencia a RIF fue frecuente en la cohorte estudiada y se asoció con un retraso en la fijación de la sonda B en la prueba Xpert.