Importance of Copy Number Alterations of FGFR1 and C-MYC Genes in Triple Negative Breast Cancer

J Med Biochem. 2019 Mar 1;38(1):63-70. doi: 10.2478/jomb-2018-0012. eCollection 2019 Mar.

Abstract

Background: Triple negative breast cancer (TNBC) is characterized by aggressive clinical course and is unresponsive to anti-HER2 and endocrine therapy. TNBC is difficult to treat and is often lethal. Given the need to find new targets for therapy we explored clinicopathological significance of copy number gain of FGFR1 and c-MYC. Our aim was to determine the impact of FGFR1 and c-MYC copy number gain on clinical course and outcome of TNBC.

Methods: FGFR1 and c-MYC gene copy number alterations were evaluated in 78 archive TNBC samples using TaqMan based quantitative real time PCR assays.

Results: 50% of samples had increased c-MYC copy number. c-MYC copy number gain was associated with TNBC in contrast to ER positive cancers. Our results showed significant correlation between c-MYC copy number gain and high grade of TNBCs. This suggests that c-MYC copy number could be an useful prognostic marker for TNBC patients. c-MYC copy number gain was associated with high pTNM stage as well as lobular and medullary tumor subtypes. 43% of samples had increased FGFR1 copy number. No correlations between FGFR1 copy number gain and clinicopathological variables were observed.

Conclusions: We identified c-MYC copy number gain as a prognostic marker for TNBC. Our results indicate that c- MYC may contribute to TNBC progression. We observed no significant association between c-MYC and/or FGFR1 copy number status and patient survival.

Uvod: Trostruko negativne karcinome dojke karakteriše agresivan klinički tok i neosetljivost na endokrinu i anti-HER2 terapiju. Ovi tumori se teško leče i često su letalni. Zbog potrebe za novim tipovima terapije, ispitali smo kliničko-patološki značaj povećanja broja kopija FGFR1 i c-MYC onkogena. Cilj rada je bio da se utvrdi uticaj povećanja broja kopija FGFR1 i c-MYC na klinički tok i ishod trostruko negativnog karcinome dojke.

Metode: Promene u broju kopija FGFR1 i c-MYC gena određene su kvantitivnim PCR-om u realnom vremenu kod 78 arhivskih uzoraka trostruko negativnog karcinome dojke.

Rezultati: 50% ispitanih uzoraka je imalo povećan broj kopija c-MYC. Povećanje broja kopija c-MYC gena je asocirano sa trostruko negativnim karcinomima dojke u poređenju sa ER pozitivnim karcinomima. Amplifikacija c-MYC je asocirana sa visokim gradusom trostruko negativnih karcinoma. Iz ovog rezultata proizilazi da bi se broj kopija c-MYC mogao smatrati korisnim prognostičkim markerom za TNBC pacijente. Povećanje broja kopija c-MYC gena je asocirano i sa visokim stadijumom tumora kao i sa lobularnim i medularnim podtipom. 43% ispitanih uzoraka je imalo povećan broj kopija FGFR 1. Nisu utvrđene nikakve korelacije između povećanja broja kopija FGFR1 i kliničkih i histopatoloških parametara tumora.

Zaključak: Utvrdili smo da je povećanje broja kopija c-MYC prognostički marker za trostruko negativne karcinome dojke. Naši rezultati pokazuju da c-MYC može da doprinese progresiji trostruko negativnih tumora. Nije opažena statistički značajna asocijacija između broja kopija c-MYC i/ili FGFR1 onkogena i preživljavanja pacijenata.

Keywords: FGFR1; c-MYC; copy number gain; triple negative breast cancer.