Changes in antimicrobial resistance levels among Escherichia coli, Salmonella, and Campylobacter in Ontario broiler chickens between 2003 and 2015

Can J Vet Res. 2018 Jul;82(3):163-177.

Abstract

Poultry has been identified as a reservoir of foodborne enteric pathogens and antimicrobial resistant bacteria. The objective of this study was to describe and compare antimicrobial resistant isolates from an Ontario broiler chicken farm-level baseline project (2003 to 2004) to the Canadian Integrated Program for Antimicrobial Resistance Surveillance (CIPARS) Ontario abattoir and retail surveillance data from 2003, and to the most recent (2015) CIPARS Ontario chicken surveillance data in order to assess the impact of an industry-wide policy change in antimicrobial use. Ceftiofur resistance (TIO-R) prevalence in Salmonella decreased by 7% on farm between 2003 and 2004 and 2015. During the same timeframe, TIO-R E. coli prevalence decreased significantly by 16%, 11%, and 8% in farm, abattoir, and retail samples, respectively. Gentamicin resistant (GEN-R) E. coli, however, increased by 10% in farm and 15% in retail-derived isolates, and trimethoprim-sulfamethoxazole resistant (TMSm-R) E. coli increased significantly by 20%, 18%, and 5% in farm, abattoir, and retail isolates, respectively. Similarly, ciprofloxacin-resistant (CIP-R) Campylobacter spp. significantly increased in retail isolates by 11% and increased in farm (33%) and abattoir isolates (7%). The decrease in TIO-R Salmonella/E. coli in recent years is consistent with the timing of an industry-led intervention eliminating the preventive use of ceftiofur, a third generation cephalosporin and class of antimicrobials deemed critically important to human medicine. The rise in GEN-R and TMSm-R prevalence is indicative of recent shifts in antimicrobial use. Our study highlights the importance of integrated surveillance in detecting emerging trends and determining the efficacy of interventions to improve food safety.

La volaille a été identifiée comme étant un réservoir d’agents pathogènes entériques d’origine alimentaire et de bactéries résistantes aux antimicrobiens. L’objectif de la présente étude était de décrire et comparer des isolats résistants aux antimicrobiens provenant d’une ferme ontarienne de poulets à griller obtenus dans le cadre d’un projet de base (2003 à 2004) aux données de surveillance de 2003 du Programme intégré canadien de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (PICRA) d’abattoir et de ventes au détail en Ontario, et aux plus récentes données de surveillance (2015) du PICRA Ontario pour la volaille afin d’évaluer l’impact d’un changement à l’ensemble de l’industrie dans l’utilisation des antimicrobiens. La prévalence de la résistance au cefiofur (TIO-R) de Salmonella a diminué de 7 % sur la ferme entre 2003 à 2004 et 2015. Durant ce même intervalle de temps, la prévalence de TIO-R de E. coli diminua de manière significative de 16 %, 11 %, et 8 % dans les échantillons provenant de la ferme, de l’abattoir et de la vente au détail, respectivement. Toutefois, les E. coli résistant à la gentamicine (GEN-R) ont augmenté de 10 % et 15 % dans les échantillons pris à la ferme et de la vente au détail, respectivement. Les E. coli résistants au trimethoprime-sulfaméthoxazole (TMSm-R) ont augmenté de manière significative par 20 %, 18 %, et 5 % dans les isolats de la ferme, de l’abattoir et de la vente au détail, respectivement. Les isolats de Campylobacter spp. résistants au ciprofloxacin (CIP-R) augmentèrent de manière significative dans les échantillons de vente au détail (11 %), ceux de la ferme (33 %) ainsi que ceux de l’abattoir (7 %). La diminution de la TIO-R chez Salmonella/E. coli au cours des dernières années concorde avec une intervention menée par l’industrie d’éliminer l’utilisation en prévention du ceftiofur, une céphalosporine de troisième génération qui est une classe d’antimicrobiens considérée d’importance critique en médecine humaine. L’augmentation de la prévalence de GEN-R et de TMSm-R est indicative d’un changement récent dans l’utilisation des antimicrobiens. Notre étude fait ressortir l’importance d’un programme intégré de surveillance pour détecter les tendances émergentes et déterminer l’efficacité des interventions pour améliorer la salubrité alimentaire.(Traduit par Docteur Serge Messier).

MeSH terms

  • Abattoirs
  • Animals
  • Anti-Bacterial Agents / pharmacology*
  • Campylobacter / drug effects*
  • Chickens / microbiology*
  • Drug Resistance, Bacterial*
  • Escherichia coli / drug effects*
  • Farms
  • Feces / microbiology
  • Ontario
  • Salmonella / drug effects*
  • Time Factors

Substances

  • Anti-Bacterial Agents