Development of an Eastern Mediterranean Region search strategy for biomedical citations indexed in PubMed

East Mediterr Health J. 2017 Nov 19;23(9):619-629. doi: 10.26719/2017.23.9.619.

Abstract

PubMed, a 'barrier-free' bibliographic database covering biomedical and health disciplines, has been successfully used to identify a multitude of indicators that assist in analyzing global trends for biomedical research productivity. The current study represents an original attempt to develop and optimize an Eastern Mediterranean Region (EMR) search strategy in PubMed to pave the way for subsequent descriptive analyses. The refined EMR search strategy contains elaborate syntaxes which facilitate controlling the search process and maintaining a proper balance between sensitivity and precision of the obtained results. Country-specific citation data were manually scanned for false positive publications. Our results indicate that publication productivity increased nearly five-fold in the EMR from 2004 to 2013. Five countries (Islamic Republic of Iran, Egypt, Saudi Arabia, Tunisia and Pakistan; in order of total publications) contributed to 80% of all EMR publications during this period. Each of the remaining 17 EMR countries contributed less than 4%. We believe that the methodology presented in this study can be used in conjunction with other metrics to extract invaluable indicators to describe EMR health research systems.

تطوير اسراتيجية لإقليم شرق المتوسط للبحث عن الاستشهادات المنقولة عن البحوث الطبية البيولوجية المفهرسة في قاعدة بيانات PubMed.

غازي تدمري، أحمد منديل، آرش رشيديان.

لقد استخدمت قاعدة البيانات PubMed، وهي قاعدة بيانات ببلوغرافية "مفتوحة" تغطي التخصصات الطبية والصحية، في تحديد عدد كبر من المؤشرات التي تساعد في تحليل الاتجاهات العالمية في إنتاج البحوث الطبية البيولوجية. وتمثِّل الدراسة الحالية محاولة أولية لتطوير بنية بحث خاصّة بإقليم شرق المتوسط وتحسينها عى النحو الأمثل في PubMed لتمهيد الطريق لإجراء تحليات وصفية لاحقة. وتتضمَّن الاسراتيجية المثالية للبحث لإقليم شرق المتوسط تركيب تفصيي للجُمل مما يسهّل التحكم في عملية البحث ويحافظ عى التوازن السليم بن حساسية النتائج التي عثر عليها ودقتها. وقد جرى تحرٍ لبيانات الاستشهادات الخاصة بالباد يدوياً للكشف عن النتائج الإيجابية الكاذبة. وتشر نتائجنا إلى أن إنتاج البحوث المنشورة قد زاد بنحو خمسة أضعاف في إقليم شرق المتوسط خال الفرة ما بن 2004-2013. ووُجد أن خمسة بلدان فقط (هي جمهورية إيران الإسامية ومر والمملكة العربية السعودية وتونس وباكستان) قد ساهمت بمقدار 80 ٪ من جميع منشورات إقليم شرق المتوسط خال هذه الفرة. وساهمت كل من البلدان السبعة عر المتبقية في إقليم شرق المتوسط با يقل عن 4 %. ونحن نعتقد أن المنهجية المعروضة في هذه الدراسة يمكن استخدامها جنباً إلى جنب مع مقاييس أخرى لاستخراج مؤشرات لا تقدَّر بثمن لوصف نُظُم البحوث الصحية في الإقليم.

Mise au point d’une stratégie de recherche pour la Région de la Méditerranée orientale en matière de citations biomédicales indexées dans PubMed.

PubMed, une base de données bibliographiques en libre accès, couvrant les disciplines des sciences biomédicales et de la santé, est utilisée avec succès pour identifier de nombreux indicateurs qui permettent d’analyser les tendances mondiales en matière de productivité de la recherche biomédicale. La présente étude constitue une tentative originale en vue de définir et d'optimiser une stratégie de recherche pour la Région de la Méditerranée orientale dans PubMed afin d'ouvrir la voie à des analyses descriptives ultérieures. Cette stratégie optimisée comporte des syntaxes complexes qui facilitent le contrôle du processus de recherche et assurent un juste équilibre entre la sensibilité et la précision des résultats obtenus. Les données de citation spécifiques à chaque pays ont été soumises à un examen manuel afin de repérer les fausses publications positives. Les résultats que nous avons obtenus indiquent que la productivité des publications a quasiment été multipliée par cinq dans la Région de la Méditerranée orientale entre 2004 et 2013. L’étude a montré que seuls cinq pays (la République islamique d’Iran, l’Égypte, l’Arabie saoudite, le Pakistan et la Tunisie ; par ordre de nombre de publications totales) ont contribué à 80 % de toutes les publications pour la Région de la Méditerranée orientale pendant cette période. La contribution de chacun des 17 pays restants de cette Région a été inférieure à 4 %. Nous pensons qu’il est possible d’utiliser la méthodologie présentée dans cette étude en association avec d’autres mesures afin de définir des indicateurs précieux permettant de décrire les systèmes de recherche en santé au sein de la Région de la Méditerranée orientale.

MeSH terms

  • Bibliometrics*
  • Biomedical Research*
  • Humans
  • Mediterranean Region
  • PubMed*