Automated image analysis methods are highly important for biotechnology research. The authors developed and tested a program for the morphometric analysis of photomicrographs of the sections processed using the standard immunohistochemical examination protocols. The color deconvolution method used in the algorithm was proven to be effective in mapping the distribution of DAB chromogen in the sample containing multiple dyes. The experiment demonstrated that the level of extracellular matrix proteins could be comparatively quantified in different groups of samples. The effective methods for the quantitative analysis of the Ki-67 labelling index were also tested using the same algorithms. The developed program was published under free GPL 3.0.
Автоматизированные методы анализа изображения являются весьма актуальными в биотехнологических исследованиях. Авторы разработали и протестировали программу для морфометрического анализа микрофотографий срезов, обработанных по стандартным протоколам иммуногистохимического исследования. Метод цветовой деконволюции, использованный в алгоритме, оказался эффективным для выделения карты распределения DAB-хромогена в образце, содержащем несколько красителей. В эксперименте продемонстрирована возможность сравнительного количественного анализа содержания белков внеклеточного матрикса в различных группах образцов. Также была протестирована эффективная методика количественного анализа индекса метки Ki-67 с использованием тех же алгоритмов. Разработанная программа опубликована под свободной лицензией GPL 3,0.
Keywords: Ki-67; color deconvolution; extracellular matrix proteins; image analysis; immunohistochemical examination; morphometric analysis.