Draft Genome Sequence of a Rare Pigmented Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Type C Strain

Pedro Barbosa; Célia Leão; Anabel Usié; Ana Amaro; Ana Botelho; Carlos Pinto; João Inácio; Karen Stevenson; António Marcos Ramos

doi:10.1128/genomeA.01066-17

Draft Genome Sequence of a Rare Pigmented Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Type C Strain

Genome Announc. 2017 Oct 12;5(41):e01066-17. doi: 10.1128/genomeA.01066-17.

Authors

Pedro Barbosa^{1

2}, Célia Leão^{1

2

3

4}, Anabel Usié^{1

2}, Ana Amaro³, Ana Botelho³, Carlos Pinto^{3

5}, João Inácio^{6

7}, Karen Stevenson⁴, António Marcos Ramos^{8

2}

Affiliations

¹ Centro de Biotecnologia Agrícola e Agroalimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.
² Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas (ICAAM), Universidade de Évora, Évora, Portugal.
³ INIAV-Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Lisbon, Portugal.
⁴ Moredun Research Institute, Penicuik, United Kingdom.
⁵ Serviço de Desenvolvimento Agrário de São Miguel, Ponta Delgada, Açores, Portugal.
⁶ School of Pharmacy and Biomolecular Sciences, University of Brighton, Brighton, United Kingdom.
⁷ Global Health and Tropical Medicine (GHTM), Instituto de Higiene e Medicina Tropical (IHMT), Universidade Nova de Lisboa, Lisbon, Portugal.
⁸ Centro de Biotecnologia Agrícola e Agroalimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal marcos.ramos@cebal.pt.

Abstract

Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis is the causative agent of paratuberculosis. We report here the draft genome sequence of a rare pigmented M. avium subsp. paratuberculosis type C strain, comprising 58 contigs and having a genome size of 4,851,414 bp. The genome will assist in the execution of pigmentation and virulence studies on this mycobacterium.