[Next generation sequencing : a diagnostic tool for inherited immune defects]

Rev Med Suisse. 2017 Apr 5;13(557):763-766.
[Article in French]

Abstract

Establishing the definitive diagnosis in the case of inherited immune defects (IID) is often challenging because the clinical features can be heterogeneous, atypical and overlapping different disease entities. The next generation sequencing technology (NGS) allows identifying genetic variants that are responsible for the observed clinical presentations. The use of NGS applied to the genes mutated in IIDs or known to be involved in the development, differentiation and regulation of the immune system allows to target hundreds of relevant genes in well characterized patients suspected of carrying inherited immune defects. This approach answers both diagnostic and research needs, facilitates the understanding of the mechanisms that underlie IIDs, and ultimately leads to the discovery of new therapeutic targets.

Etablir un diagnostic précis est souvent difficile dans le cas des déficits immunitaires héréditaires (DIH) car les manifestations cliniques sont hétérogènes et parfois atypiques ou communes à des maladies distinctes. Le séquençage à haut débit, aussi appelé next generation sequencing (NGS), permet d’identifier des variants génétiques responsables de caractéristiques cliniques. Le recours au NGS pour découvrir les gènes mutés dans les DIH ou connus pour être impliqués dans le développement, la différenciation et la régulation du système immunitaire, permet de cibler des centaines de gènes d’intérêt sur des patients suspectés de DIH pour lesquels le tableau clinique est documenté. Cette approche répond à la fois à des besoins de diagnostic et de recherche pour comprendre les mécanismes qui régissent les DIH et découvrir de nouveaux outils ou cibles thérapeutiques.

MeSH terms

  • High-Throughput Nucleotide Sequencing / methods*
  • Humans
  • Immune System Diseases / diagnosis*
  • Immune System Diseases / genetics
  • Immunologic Deficiency Syndromes / diagnosis*
  • Immunologic Deficiency Syndromes / genetics
  • Mutation