Background: Helicobacter pylori plays a significant role in gastritis and ulcers. It is a carcinogen as defined by the WHO, and infection can result in adenocarcinomas and mucosa-associated lymphoid tissue lymphomas. In Canada, rates of antimicrobial resistance are relatively unknown, with very few studies conducted in the past 15 years.
Objective: To examine rates of resistance in Sudbury, Ontario, compare antimicrobial susceptibility methods and attempt to determine the molecular basis of antibiotic resistance.
Methods: Patients attending scheduled visits at Health Sciences North (Sudbury, Ontario) provided gastric biopsy samples on a volunteer basis. In total, 20 H pylori isolates were collected, and antimicrobial susceptibility testing (on amoxicillin, tetracycline, metronidazole, ciprofloxacin, levofloxacin and clarithromycin) was conducted using disk diffusion and E-test methods. Subsequently, genomic DNA from these isolates was sequenced to detect mutations associated with antimicrobial resistance.
Results: Sixty-five percent of the isolates were found to be resistant to at least one of the listed antibiotics according to E-test. Three isolates were found to be resistant to ≥3 of the above-mentioned antibiotics. Notably, 25% of the isolates were found to be resistant to both metronidazole and clarithromycin, two antibiotics that are normally prescribed as part of first-line regimens in the treatment of H pylori infections in Canada and most of the world. Among the resistant strains, the sequences of 23S ribosomal RNA and gyrA, which are linked to clarithromycin and ciprofloxacin/levofloxacin resistance, respectively, revealed the presence of known point mutations associated with antimicrobial resistance.
Conclusions: In general, resistance to metronidazole, ciprofloxacin/levofloxacin and clarithromycin has increased since the studies in the early 2000s. These results suggest that surveillance programs of H pylori antibiotic resistance may need to be revisited or improved to prevent antimicrobial therapy failure.
Historique: L’Helicobacter pylori contribue énormément à la gastrite et aux ulcères. L’OMS le définit comme un cancérigène, et l’infection peut provoquer l’apparition d’adénocarcinomes et de lymphomes de tissus lymphoïdes associés aux muqueuses. Au Canada, on connaît relativement peu les taux de résistance antimicrobienne, car très peu d’études ont été réalisées sur le sujet depuis 15 ans.
Objectif: Examiner les taux de résistance à Sudbury, en Ontario, comparer les méthodes de susceptibilité antimicrobienne et tenter de déterminer le fondement biologique de la résistance antibiotique.
Méthodologie: Les patients qui allaient à un rendez-vous prévu au Health Sciences North de Sudbury ont remis les résultats de biopsies gastriques sur une base volontaire. Au total, 20 isolats de H pylori ont été recueillis, et les tests de susceptibilité antimicrobienne (à l’amoxicilline, à la tétracycline, au métronidazole, à la ciprofloxacine, à la lévofloxacine et à la clarithromycine) ont été effectués au moyen de la diffusion sur disque et de l’essai E. L’ADN génomique de ces isolats a ensuite été séquencé pour déceler les mutations associées à la résistance antimicrobienne.
Résultats: Selon l’essai E, 65 % des isolats étaient résistants à au moins un des antibiotiques énumérés. Notamment, 25 % des isolats étaient résistants à la fois au métronidazole et à la clarithromycine, tous deux normalement prescrits en première ligne pour traiter les infections à H pylori au Canada et dans la plupart des régions du monde. Parmi les souches résistantes, les séquences d’ARN ribosomique 23S et de gyrA, qui sont liées à la résistance à la clarithromycine et à la ciprofloxacine-lévofloxacine, respectivement, révélaient la présence de mutations de points connus associés à une résistance antimicrobienne.
Conclusions: En général, la résistance au métronidazole, à la ciprofloxacine-lévofloxacine et à la clarithromycine a augmenté depuis les études réalisées au début des années 2000. D’après ces résultats, il faudra peut-être revoir ou améliorer les programmes de surveillance de l’antibiorésistance au H pylori pour prévenir l’échec du traitement antimicrobien.
Keywords: Antimicrobial susceptibility; Helicobacter pylori; Northern Ontario; Resistance.