Association between the genetic similarity of the open reading frame 5 sequence of Porcine reproductive and respiratory syndrome virus and the similarity in clinical signs of Porcine reproductive and respiratory syndrome in Ontario swine herds

Can J Vet Res. 2014 Oct;78(4):250-9.

Abstract

A study of Ontario swine farms positive for Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) tested the association between genetic similarity of the virus and similarity of clinical signs reported by the herd owner. Herds were included if a positive result of polymerase chain reaction for PRRSV at the Animal Health Laboratory at the University of Guelph, Guelph, Ontario, was found between September 2004 and August 2007. Nucleotide-sequence similarity and clinical similarity, as determined from a telephone survey, were calculated for all pairs of herds. The Mantel test indicated that clinical similarity and sequence similarity were weakly correlated for most clinical signs. The generalized additive model indicated that virus homology with 2 vaccine viruses affected the association between sequence similarity and clinical similarity. When the data for herds with vaccine-like virus were removed from the dataset there was a significant association between virus similarity and similarity of the reported presence of abortion, stillbirth, preweaning mortality, and sow/boar mortality. Ownership similarity was also found to be associated with virus similarity and with similarity of the reported presence of sows being off-feed, nursery respiratory disease, nursery mortality, finisher respiratory disease, and finisher mortality. These results indicate that clinical signs of PRRS are associated with PRRSV genotype and that herd ownership is associated with both of these.

Une étude effectuée sur des fermes porcines ontariennes positives pour le virus du SRRP a testé l’association entre la similarité génétique des virus SRRP et la similarité des signes cliniques rapportés par le propriétaire des animaux. Les élevages pouvaient être inclus si un résultat positif par PCR pour le virus du SRRP avait été obtenu du Animal Health Laboratory de l’Université de Guelph entre les mois de septembre 2004 et août 2007. Les similarités des séquences virales et les similarités cliniques notées suite à une enquête ont été calculées pour chaque paire de troupeaux. Le test de Mantel indiquait que les similarités cliniques et les similarités virales étaient faiblement corrélées pour la plupart des signes cliniques. Le modèle additif généralisé indiquait que des virus homologues à deux virus vaccinaux affectaient l’association entre les similarités virales et les similarités cliniques. Lorsque les troupeaux avec les virus similaires aux vaccins furent retirés des données, il y avait une association significative entre les similarités virales et des similarités pour les avortements, les mort-nés, la mortalité pré-sevrage et la mortalité des truies et verrats. Les similarités de propriété ont également été déterminées comme étant associées avec les similarités virales et les similarités cliniques suivantes : truies sans appétit, maladies respiratoires en pouponnière, mortalité en pouponnière, maladies respiratoires chez les porcs en finition, et mortalités chez les porcs en finition. Ces résultats indiquent que les signes cliniques de SRRP sont associés avec le génotype du virus du SRRP et que la propriété du troupeau est associée avec ces deux éléments.(Traduit par Docteur Serge Messier).

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Animals
  • Female
  • Male
  • Multivariate Analysis
  • Ontario
  • Open Reading Frames / genetics*
  • Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome / pathology
  • Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome / virology*
  • Porcine respiratory and reproductive syndrome virus / genetics*
  • Pregnancy
  • RNA, Viral / chemistry
  • RNA, Viral / genetics
  • Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction / veterinary
  • Sequence Analysis, DNA / veterinary
  • Statistics, Nonparametric
  • Swine
  • Viral Vaccines / genetics*

Substances

  • RNA, Viral
  • Viral Vaccines