Genetic diversity among Trypanosoma (Duttonella) vivax strains from Zambia and Ghana, based on cathepsin L-like gene

Parasite. 2013:20:24. doi: 10.1051/parasite/2013024. Epub 2013 Jul 1.

Abstract

Understanding the evolutionary relationships of Trypanosoma (Duttonella) vivax genotypes between West Africa and Southern Africa can provide information on the epidemiology and control of trypanosomosis. Cattle blood samples from Zambia and Ghana were screened for T. vivax infection using specie-specific PCR and sequencing analysis. Substantial polymorphism was obtained from phylogenetic analysis of sequences of cathepsin L-like catalytic domains. T. vivax from Ghana clustered together with West African and South American sequences, while T. vivax from Zambia formed one distinct clade and clustered with East African and Southern African sequences. This study suggests existence of distinct genetic diversity between T. vivax genotypes from West Africa and Zambia as per their geographical origins.

Comprendre les relations évolutives des génotypes de Trypanosoma (Duttonella) vivax d’Afrique de l’Ouest et du Sud peut fournir des informations sur l’épidémiologie et le contrôle de la trypanosomiase. Des échantillons de sang de bétail de Zambie et du Ghana ont été testés pour l’infection à T. vivax en utilisant une PCR spécifique à l’espèce et en analysant les séquences. Un polymorphisme substantiel a été obtenu par une analyse phylogénétique des séquences de domaines catalytiques similaires à la cathepsine L. T. vivax du Ghana était groupé avec les séquences d’Afrique de l’Ouest et d’Amérique du Sud, alors que T. vivax de Zambie formait un clade distinct et était groupé avec des séquences d’Afrique de l’Est et du Sud. Cette étude suggère l’existence d’une diversité génétique distincte des génotypes de T. vivax d’Afrique de l’Ouest et de Zambie en fonction de leurs origines géographiques.

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Animals
  • Base Sequence
  • Cathepsin L / genetics*
  • Cattle
  • Cattle Diseases / parasitology*
  • Cluster Analysis
  • DNA, Protozoan / chemistry
  • Genetic Variation*
  • Genotype
  • Ghana
  • Molecular Sequence Data
  • Phylogeny
  • Trypanosoma vivax / classification
  • Trypanosoma vivax / genetics*
  • Trypanosomiasis, African / parasitology
  • Trypanosomiasis, African / veterinary*
  • Zambia

Substances

  • DNA, Protozoan
  • Cathepsin L

Associated data

  • GENBANK/AB781071
  • GENBANK/AB781072
  • GENBANK/AB781073
  • GENBANK/AB781074
  • GENBANK/AB781075
  • GENBANK/AB781076
  • GENBANK/AB781077
  • GENBANK/AB781078