Among grow-to-finish pigs from 10 herds in Alberta and Saskatchewan, 23 (16%) of 144 fecal samples were culture-positive and 40 (28%) of 144 pigs were seropositive for Salmonella. With a Bayesian model specifying dependence between the 2 tests, the sensitivity (Se) of culture and real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) was 79% to 86%, depending on the cut-off value for the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Culture specificity (Sp) was assumed to be 100%; RT-PCR Sp was found to be 94%. The ELISA Se was 76% and 51% at optical density cut-off values ≥ 20% and ≥ 40%, respectively; the Sp was 94% at each cut-off value. The model showed some sensitivity to ELISA prior information, the ELISA Se being approximately 8% lower when informative prior information was specified in the model. When there was no adjustment for dependence between culture and RT-PCR, the posterior estimates for both culture and RT-PCR Se were 11% higher than with the conditional-dependence model and had considerably narrower probability intervals, which suggests that correlation between culture and PCR is important and should be adjusted for in future studies.
Parmi des porcs en période de croissance-finition dans 10 troupeaux en Alberta et Saskatchewan, 23 (16 %) des 144 échantillons fécaux étaient positifs à la culture et 40 (28 %) des 144 porcs étaient séropositifs pour Salmonella. À l’aide d’un modèle Bayesien spécifiant la dépendance entre les 2 tests, la sensibilité (Se) de la culture et d’une réaction d’amplification en chaîne par la polymérase en temps réel (RT-PCR) était de 79 % à 86 %, selon la valeur seuil de l’épreuve immuno-enzymatique (ELISA). La spécificité de la culture (Sp) était considérée comme étant de 100 %; la Sp du RT-PCR était de 94 %. La Se de l’ELISA était de 76 % et 51 % lorsque les valeurs seuils de densité optique étaient respectivement ≥ 20 % et ≥ 40 %; la Sp était de 94 % à chacune des valeurs seuils. Le modèle démontrait une certaine sensibilité à des informations préalables à l’ELISA, la Se de l’ELISA étant environ 8 % plus basse lorsque des informations préalables pertinentes étaient spécifiées dans le modèle. Lorsqu’aucun ajustement pour la dépendance entre la culture et le RT-PCR n’était fait, les estimés a posteriori pour la culture et le RT-PCR étaient 11 % plus élevés qu’avec le modèle à dépendance-conditionnelle et avaient des intervalles de probabilité considérablement plus étroits, ce qui suggère que la corrélation entre la culture et le PCR est importante et devrait être ajustée lors d’études ultérieures.
(Traduit par Docteur Serge Messier)