A simplified PCR method for genotyping Mycoplasma mycoides subspecies mycoides small colony: the aetiologic agent of contagious bovine pleuropneumonia

Vet Microbiol. 2012 Sep 14;159(1-2):257-9. doi: 10.1016/j.vetmic.2012.03.011. Epub 2012 Mar 13.

Abstract

Mycoplasma mycoides subspecies mycoides small colony is the aetiological agent of contagious bovine pleuropneumonia, a cattle disease endemic to areas of sub-Saharan Africa. Twenty isolates from various geographical locations and the type strain were analysed by multi-locus sequence analysis (MLSA). The data generated was then used to develop three PCR primer sets to differentiate these isolates. The PCRs differentiated the isolates into four groups; the type strain (T); isolates of European origin (Eu); isolates from Tanzania (Af1) with a final group consisting of isolates from Namibia and Botswana (Af2). These PCRs offers a rapid and efficient post-identification typing method without the need to sequence and analyse multiple genes.

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Africa South of the Sahara
  • Animals
  • Cattle
  • Cattle Diseases / diagnosis
  • Cattle Diseases / microbiology*
  • DNA Primers / genetics
  • Genotype
  • Genotyping Techniques / veterinary*
  • Molecular Sequence Data
  • Mycoplasma mycoides / classification
  • Mycoplasma mycoides / genetics*
  • Mycoplasma mycoides / isolation & purification
  • Pleuropneumonia, Contagious / microbiology*
  • Polymerase Chain Reaction
  • Polymorphism, Single Nucleotide

Substances

  • DNA Primers

Associated data

  • GENBANK/JQ307942
  • GENBANK/JQ307943
  • GENBANK/JQ307944
  • GENBANK/JQ307945
  • GENBANK/JQ307946
  • GENBANK/JQ307947
  • GENBANK/JQ307948
  • GENBANK/JQ307949
  • GENBANK/JQ307950
  • GENBANK/JQ307951
  • GENBANK/JQ307952
  • GENBANK/JQ307953
  • GENBANK/JQ307954
  • GENBANK/JQ307955
  • GENBANK/JQ307956
  • GENBANK/JQ307957
  • GENBANK/JQ307958
  • GENBANK/JQ307959
  • GENBANK/JQ307960
  • GENBANK/JQ307961
  • GENBANK/JQ307962
  • GENBANK/JQ307963
  • GENBANK/JQ307964
  • GENBANK/JQ307965
  • GENBANK/JQ307966
  • GENBANK/JQ307967
  • GENBANK/JQ307968
  • GENBANK/JQ307969
  • GENBANK/JQ307970
  • GENBANK/JQ307971
  • GENBANK/JQ307972
  • GENBANK/JQ307973
  • GENBANK/JQ307974
  • GENBANK/JQ307975
  • GENBANK/JQ307976
  • GENBANK/JQ307977
  • GENBANK/JQ307978
  • GENBANK/JQ307979
  • GENBANK/JQ307980
  • GENBANK/JQ307981
  • GENBANK/JQ307982
  • GENBANK/JQ307983
  • GENBANK/JQ307984
  • GENBANK/JQ307985
  • GENBANK/JQ307986
  • GENBANK/JQ307987
  • GENBANK/JQ307988
  • GENBANK/JQ307989
  • GENBANK/JQ307990
  • GENBANK/JQ307991
  • GENBANK/JQ307992
  • GENBANK/JQ307993
  • GENBANK/JQ307994
  • GENBANK/JQ307995
  • GENBANK/JQ307996
  • GENBANK/JQ307997
  • GENBANK/JQ307998
  • GENBANK/JQ307999
  • GENBANK/JQ308000
  • GENBANK/JQ308001
  • GENBANK/JQ308002
  • GENBANK/JQ308003
  • GENBANK/JQ308004
  • GENBANK/JQ308005
  • GENBANK/JQ308006
  • GENBANK/JQ308007
  • GENBANK/JQ308008
  • GENBANK/JQ308009
  • GENBANK/JQ308010
  • GENBANK/JQ308011
  • GENBANK/JQ308012
  • GENBANK/JQ308013
  • GENBANK/JQ308014
  • GENBANK/JQ308015
  • GENBANK/JQ308016
  • GENBANK/JQ308017
  • GENBANK/JQ308018
  • GENBANK/JQ308019
  • GENBANK/JQ308020
  • GENBANK/JQ308021
  • GENBANK/JQ308022
  • GENBANK/JQ308023
  • GENBANK/JQ308024
  • GENBANK/JQ308025
  • GENBANK/JQ308026
  • GENBANK/JQ308027
  • GENBANK/JQ308028
  • GENBANK/JQ308029
  • GENBANK/JQ308030
  • GENBANK/JQ308031
  • GENBANK/JQ308032
  • GENBANK/JQ308033
  • GENBANK/JQ308034
  • GENBANK/JQ308035
  • GENBANK/JQ308036
  • GENBANK/JQ308037
  • GENBANK/JQ308038
  • GENBANK/JQ308039
  • GENBANK/JQ308040
  • GENBANK/JQ308041
  • GENBANK/JQ308042
  • GENBANK/JQ308043
  • GENBANK/JQ308044
  • GENBANK/JQ308045
  • GENBANK/JQ308046
  • GENBANK/JQ308047
  • GENBANK/JQ308048
  • GENBANK/JQ308049
  • GENBANK/JQ308050
  • GENBANK/JQ308051
  • GENBANK/JQ308052
  • GENBANK/JQ308053
  • GENBANK/JQ308054
  • GENBANK/JQ308055
  • GENBANK/JQ308056
  • GENBANK/JQ308057
  • GENBANK/JQ308058
  • GENBANK/JQ308059
  • GENBANK/JQ308060
  • GENBANK/JQ308061
  • GENBANK/JQ308062
  • GENBANK/JQ308063
  • GENBANK/JQ308064
  • GENBANK/JQ308065
  • GENBANK/JQ308066
  • GENBANK/JQ308067
  • GENBANK/JQ308068
  • GENBANK/JQ308069
  • GENBANK/JQ308070
  • GENBANK/JQ308071
  • GENBANK/JQ308072
  • GENBANK/JQ308073
  • GENBANK/JQ308074
  • GENBANK/JQ308075
  • GENBANK/JQ308076
  • GENBANK/JQ308077
  • GENBANK/JQ308078
  • GENBANK/JQ308079
  • GENBANK/JQ308080
  • GENBANK/JQ308081
  • GENBANK/JQ308082
  • GENBANK/JQ308083
  • GENBANK/JQ308084
  • GENBANK/JQ308085
  • GENBANK/JQ308086
  • GENBANK/JQ308087
  • GENBANK/JQ308088
  • GENBANK/JQ308089
  • GENBANK/JQ308090
  • GENBANK/JQ308091
  • GENBANK/JQ308092
  • GENBANK/JQ308093
  • GENBANK/JQ308094
  • GENBANK/JQ308095
  • GENBANK/JQ308096
  • GENBANK/JQ308097
  • GENBANK/JQ308098
  • GENBANK/JQ308099
  • GENBANK/JQ308100
  • GENBANK/JQ308101
  • GENBANK/JQ308102
  • GENBANK/JQ308103