Evidence for persistence of and antiviral resistance and reassortment events in seasonal influenza virus strains circulating in Cambodia

J Clin Microbiol. 2010 Jan;48(1):295-7. doi: 10.1128/JCM.01687-09. Epub 2009 Nov 4.

Abstract

The analysis of A/H1N1 and A/H3N2 influenza viruses collected between 2005 and 2008 in Cambodia detected strains resistant to oseltamivir and confirmed widespread resistance to adamantanes. Phylogenetic analyses revealed intrasubtype reassortment, probable reemergence of A/H3N2 viruses in two consecutive seasons, and cocirculation of different lineages in each subtype.

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't
  • Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.

MeSH terms

  • Antiviral Agents / pharmacology*
  • Cambodia / epidemiology
  • Cluster Analysis
  • Drug Resistance, Viral*
  • Genotype
  • Humans
  • Influenza A Virus, H1N1 Subtype / classification*
  • Influenza A Virus, H1N1 Subtype / drug effects*
  • Influenza A Virus, H1N1 Subtype / genetics
  • Influenza A Virus, H1N1 Subtype / isolation & purification
  • Influenza A Virus, H3N2 Subtype / classification*
  • Influenza A Virus, H3N2 Subtype / drug effects*
  • Influenza A Virus, H3N2 Subtype / genetics
  • Influenza A Virus, H3N2 Subtype / isolation & purification
  • Influenza, Human / epidemiology
  • Influenza, Human / virology*
  • Molecular Epidemiology
  • Molecular Sequence Data
  • Phylogeny
  • RNA, Viral / genetics
  • Reassortant Viruses / classification
  • Reassortant Viruses / drug effects
  • Reassortant Viruses / genetics
  • Reassortant Viruses / isolation & purification
  • Sequence Analysis, DNA
  • Sequence Homology

Substances

  • Antiviral Agents
  • RNA, Viral

Associated data

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