Escherichia coli (n = 1439), isolated from the feces of apparently healthy grow-finish pigs in 20 herds in Alberta and Saskatchewan, were tested for susceptibility to 16 antimicrobials. All isolates were susceptible to amikacin, ceftriaxone, and ciprofloxacin and less than 1% was resistant to amoxicillin-clavulanic acid, cefoxitin, ceftiofur, gentamicin, and nalidixic acid. Resistance was most common to tetracycline (66.8%), sulfamethoxazole (46.0%) and streptomycin (33.4%). Twenty-one percent of the isolates were susceptible to all drugs, while 57% were resistant to 2 or more antimicrobials. Unconditional associations between resistances provided insight into the potential for co-selection. Every resistance-outcome was associated with at least 2 other drug-resistances. These associations illustrate the propensity for resistance phenotypes to occur together and the importance of considering co-selection in antimicrobial use decisions. A 2nd analysis explored the associations between resistance phenotypes in E. coli and Salmonella spp. from the same herd. Only 2 resistances in Salmonella were associated with herd-level E. coli resistance, indicating that E. coli is a poor sentinel for Salmonella AMR within herds. Herd-level management, including antimicrobial use, could affect antimicrobial resistance. The intra-class correlation between isolates within herds ranged from 0.1 to 0.46, which confirmed resistance clustered within herds. This suggests herd-level interventions might mitigate antimicrobial resistance. Overall, these results reflect the on-farm selection pressure for resistance and the potential food-safety risk from near-market animals. These data provide a baseline for comparisons with future on-farm monitoring of antimicrobial resistance in E. coli.
Des isolats d’Escherichia coli (n = 1439), provenant des fèces de porcs en santé en croissance-finition prélevées dans 20 troupeaux de l’Alberta et de la Saskatchewan, ont été testés pour leur sensibilité à 16 agents antimicrobiens. Tous les isolats étaient sensibles aux antimicrobiens suivants : amikacine, ceftriaxone et ciprofloxacin; et moins de 1 % était résistant à : amoxicilline-acide clavulanique, cefoxitin, ceftiofur, gentamycine et acide nalidixique. De la résistance était fréquente à la tétracycline (66,8 %), au sulfaméthoxazole (46,0 %) et à la streptomycine (33,4 %). Une sensibilité envers tous les antimicrobiens était notée pour 21 % des isolats, alors que 57 % étaient résistants à 2 antimicrobiens ou plus. Des associations inconditionnelles entre des résistances ont fourni des informations sur le potentiel de co-sélection. Chaque résultat de résistance était associé à au moins 2 autres résistances. Ces associations démontrent la propension pour les phénotypes de résistance à se produire ensemble et l’importance de considérer la co-sélection lors des décisions dans l’utilisation des antimicrobiens. Une deuxième analyse a exploré les associations entre les phénotypes de résistance d’E. coli et de Salmonella spp. provenant d’un même troupeau. Seulement 2 résistances chez Salmonella étaient associées à de la résistance chez E. coli au niveau du troupeau, indiquant ainsi qu’E. coli n’est pas un bon indicateur de l’antibiorésistance de Salmonella dans un même troupeau. La gestion du troupeau, incluant l’utilisation des antimicrobiens, pourrait affectée la résistance aux antimicrobiens. La corrélation intra-classe entre les isolats à l’intérieur d’un troupeau variait de 0,1 à 0,46, ce qui confirme que la résistance était regroupée à l’intérieur des troupeaux. Ceci suggère que les interventions au niveau du troupeau pourraient limiter la résistance aux antimicrobiens. De manière globale, ces résultats reflètent la sélection de pression pour la résistance sur la ferme et le risque potentiel pour la santé publique que représente les animaux prêts à être commercialisés. Ces résultats fournissent des données de base comparatives pour la surveillance à la ferme de la résistance aux antimicrobiens chez E. coli.
(Traduit par Docteur Serge Messier)