Swine Hepatitis E virus (HEV) could be a zoonotic agent for HEV infection in humans. In Canada, approximately 60% of 6-mo-old commercial pigs are seropositive for HEV; the prevalence is higher in the provinces of Quebec and Ontario. A study was set up to evaluate the presence of swine HEV in Quebec farms and to compare the strains detected in fecal samples with human and swine HEV strains reported worldwide. Fecal samples were collected randomly from May 2003 to January 2004 from 70 swine farms in Quebec. In 24 specimens, representing 34% of the visited farms, HEV RNA was extracted and detected by nested reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). All amplified nested RT-PCR products were purified, cloned, and sequenced. The nucleotide sequences of a 304 base pair fragment at the 5' end of the open reading frame 2 gene were determined. Phylogenetic analysis revealed that the 24 amplified fragments clustered in genotype 3 and had 85% to 99% nucleotide-sequence similarity with HEV strains identified in Japan, the United States, and Canada. Three strains identified in the study (swSTHY1, swSTHY31, and swSTHY47) showed 95% homology with 2 Japanese (swJ1-1 and HE-JA10) and 1 American (US1) HEV human strains.
Le virus de l’Hépatite E (HEV) chez le porc pourrait être un agent zoonotique responsable d’infections chez l’humain. Au Canada, approximativement 60 % des porcs commercialisés de 6 mois sont séropositifs pour HEV, avec une prévalence plus élevée pour les provinces de Québec et de l’Ontario. Dans cette étude nous avons évalué la présence de HEV porcin dans différentes fermes du Québec et comparé les souches détectées dans les matières fécales avec les souches de HEV d’origine porcine et humaine retrouvées à travers le monde. Des échantillons de matière fécale de porc ont été récupérés de façon aléatoire de mai 2003 à janvier 2004 dans 70 fermes du Québec. L’ARN de HEV a été extrait des matières fécales et détecté par réaction d’amplification en chaîne nichée à l’aide de la transcriptase reverse (RT-PCR niché) dans 24 échantillons, représentant 34 % des fermes visitées. Tous les produits d’amplification obtenus par RT-PCR niché ont été purifiés, clonés et séquencés. Les séquences obtenues, d’une longueur de 304 paires de base, sont situées à l’extrémité 5′ du gène ORF2. L’analyse phylogénétique démontre que les 24 produits d’amplification de HEV porcin sont regroupés dans le génotype 3 et que ceux-ci possèdent une similarité de la séquence en nucléotides qui se situe entre 85 % et 99 % avec des séquences de HEV déjà identifiées au Japon, aux États-Unis et au Canada. Trois séquences identifiées dans cette étude (swSTHY1, swSTHY31 et swSTHY47) démontrent 95 % d’homologie avec deux souches japonaise (swJ1-1 et HE-JA10) et une souche américaine (US1) de HEV d’origine humaine.
(Traduit par les auteurs)