Diversity and distribution of Planctomycetes and related bacteria in the suboxic zone of the Black Sea

Appl Environ Microbiol. 2006 Apr;72(4):3079-83. doi: 10.1128/AEM.72.4.3079-3083.2006.

Abstract

Samples from six depths of the Black Sea's suboxic zone were analyzed for 16S rRNA gene sequence information. A gradient in phylotype diversity was found. The distributions of known anaerobic ammonium oxidation (anammox) bacteria, many unknown Planctomycetes, and other phylotypes were examined in relation to the local nutrient and redox conditions.

Publication types

  • Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.

MeSH terms

  • Bacteria, Anaerobic / classification*
  • Bacteria, Anaerobic / genetics
  • Bacteria, Anaerobic / growth & development*
  • Bacteria, Anaerobic / metabolism
  • DNA, Bacterial / analysis
  • Molecular Sequence Data
  • Oceans and Seas
  • Oxidation-Reduction
  • Oxygen / metabolism
  • Phylogeny
  • Quaternary Ammonium Compounds / metabolism*
  • RNA, Ribosomal, 16S / genetics
  • Seawater / chemistry
  • Seawater / microbiology*
  • Sequence Analysis, DNA

Substances

  • DNA, Bacterial
  • Quaternary Ammonium Compounds
  • RNA, Ribosomal, 16S
  • Oxygen

Associated data

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