Epidermal growth factor (EGF) is a potent mitogen for a variety of cell types. The 53-amino acid mature EGF protein is encoded by sequences in exons 20 and 21 of a gene spanning over 110 kb. In this study, we report the cloning and characterization of 7.5 kb of bovine genomic sequence homologous to exon 19 through 21 from EGF genes from other mammalian species. The cloned gene fragment had an unusual sequence composition in the form of an in-frame TGA codon in the coding sequence. The sequence was expressed at low levels in kidney tissue and the corresponding cDNA contained the TGA codon. The level of similarity between the bovine exonic sequence and the human, porcine, murine, feline, and canine corresponding sequences varied from 64% to 73%; however, when only sequences encoding the mature EGF protein were compared, the level of similarity between the bovine sequence and the sequence from these species was 59% to 66%. The sequence similarity of the deduced mature protein was lower (34% to 39%) than the sequence similarity of the deduced propeptide. Although the cloned sequences could originate from a bovine EGF pseudogene, the possibility exists that they originate from the functional EGF gene. An as yet unidentified mechanism to by-pass the stop codon would allow the synthesis of a functional EGF protein. Alternatively, the cloned sequence could originate from an EGF-like gene.
Le facteur de croissance épidermique (EGF) est un mitogène puissant pour plusieurs types de cellules. La protéine EGF mature possède 53 acides aminés et est encodée par des séquences dans les exons 20 et 21 d’un gène qui fait plus de 110 kb. Cette étude fait état du clonage et de la caractérisation d’une séquence de 7,5 kb du génome bovin homologue aux exons 19 à 21 des gènes de EGF provenant de d’autres espèces mammaliennes. Le fragment de gène cloné avait une composition de séquence inhabituelle dans la forme d’un codon TGA enchassé dans la séquence codante. De faibles niveaux de la séquence étaient exprimés dans le tissu rénal et le cDNA correspondant contenait le codon TGA. Le degré de similarité entre la séquence bovine exonique et les séquences correspondantes humaine, porcine, murine, féline et canine variait de 64 à 73 %; toutefois, quand seulement les séquences codant la protéine EGF mature étaient comparées, le degré de similarité entre la séquence bovine et les séquences des autres espèces était de 59 à 66 %. La similarité de séquence de la protéine mature déduite était inférieure (34 à 39 %) que la similarité de séquence du propeptide déduit. Bien que les séquences clonées pouvaient provenir d’un pseudogène EGF bovin, la possibilité existe que leur origine soit le gène EGF fonctionnel. Un mécanisme non encore identifié pour contourner le codon d’arrêt permettrait la synthèse d’une protéine EGF fonctionnelle. De manière alternative, la séquence clonée pourrait provenir d’un gene EGF apparenté.
(Traduit par Docteur Serge Messier)