Nomenclature for standardized designation of diploid genotypes in genetically modified laboratory animals

Lab Anim. 2023 Aug;57(4):371-380. doi: 10.1177/00236772231175727.

Abstract

Information about the diploid genotype of a gene-modified or mutant laboratory animal is essential for breeding and experimental planning. It is also required for the exchange of animals between different research groups or for communication with professional genotyping service providers. While there are detailed, standardized rules for creating an allele name of a genome modification or mutation, the notation of the diploid genotype after biopsy and genotyping has not been standardized yet. Therefore, a uniform, generally understandable nomenclature for the diploid genotype of gene-modified laboratory animals is needed. With the here-proposed nomenclature recommendations from the Committee on Genetics and Breeding of Laboratory Animals of the German Society for Laboratory Animal Science (GV-SOLAS), we provide a practical, standardized representation of the genotype of gene-modified animals. It is intended to serve as a compact guide for animal care and scientific personnel in animal research facilities and to simplify data exchange between groups and with external service providers.

L’information sur le génotype diploïde d’un animal de laboratoire mutant ou modifié par un gène est essentielle, non seulement pour la reproduction et la planification expérimentale, mais également pour l’échange d’animaux entre différents groupes de recherche ou pour la communication avec les fournisseurs de services professionnels de génotypage. Bien qu’il existe des règles détaillées et normalisées pour créer le nom d’un allèle de modification ou de mutation génomique, la notation du génotype diploïde après la biopsie et le génotypage n’a pas encore été standardisée. Une nomenclature uniforme, généralement compréhensible, pour le génotype diploïde des animaux de laboratoire modifiés par des gènes s’avère donc nécessaire. Avec les recommandations de nomenclature proposées ici par le Comité de génétique et d’élevage des animaux de laboratoire de la Société allemande de science des animaux de laboratoire (GV-SOLAS), nous fournissons une représentation pratique et standardisée du génotype des animaux génétiquement modifiés. Elle est destinée à servir de guide compact pour le personnel scientifique et de soin des animaux dans les installations de recherche sur les animaux et à simplifier l’échange de données entre les groupes et avec les prestataires de services externes.

Informationen über den diploiden Genotyp eines genveränderten oder mutierten Versuchstiers sind für die Zucht- und Versuchsplanung unerlässlich. Sie werden auch für den Austausch von Tieren zwischen verschiedenen Forschungsgruppen oder für die Kommunikation mit kommerziellen Genotypisierungsanbietern benötigt. Während es für die Erstellung eines Allelnamens einer Genomveränderung oder Mutation detaillierte, standardisierte Regeln gibt, ist die Notation des diploiden Genotyps nach Biopsie und Genotypisierung noch nicht genormt. Daher wird eine einheitliche, allgemein verständliche Nomenklatur für den diploiden Genotyp von genveränderten Versuchstieren benötigt. Mit den hier vorgeschlagenen Nomenklatur-Empfehlungen des Ausschusses für Genetik und Züchtung der Versuchstiere der Gesellschaft für Versuchstierkunde (GV-SOLAS) wird eine praxisnahe, standardisierte Beschreibung des Genotyps genveränderter Tiere vorgelegt. Sie soll als kompakter Leitfaden für das tierpflegerische und wissenschaftliche Personal in Tierforschungseinrichtungen dienen und den Datenaustausch zwischen Gruppen und mit externen Dienstleistern vereinfachen.

La información sobre el genotipo diploide de un animal de laboratorio modificado genéticamente o mutante es fundamental para la cría y la planificación experimental. También es necesario para el intercambio de animales entre distintos grupos de investigación o para la comunicación con proveedores profesionales de servicios de genotipado. Aunque existen reglas detalladas y estandarizadas para crear un nombre de alelo de una modificación o mutación genómica, la notación del genotipo diploide tras la biopsia y el genotipado aún no se ha estandarizado. Por ello, se necesita una nomenclatura uniforme y generalmente comprensible para el genotipo diploide de los animales de laboratorio modificados genéticamente. Con las recomendaciones de nomenclatura aquí propuestas por el Comité de Genética y Cría de Animales de Laboratorio de la Sociedad Alemana para la Ciencia de Animales de Laboratorio (GV-SOLAS), facilitamos una representación práctica y estandarizada del genotipo de los animales modificados genéticamente. Su objetivo es servir de guía compacta para el personal científico y de cuidado de animales en las instalaciones de investigación animal y simplificar el intercambio de datos entre grupos y con proveedores de servicios externos.

Keywords: Diagnostic assay; GM models; PCR; genetics; organisms and models; policy; quality assurance/control; techniques.

MeSH terms

  • Animal Husbandry
  • Animals
  • Diploidy*
  • Genotype
  • Laboratory Animal Science*