As an important element in the regional containment of the COVID-19 pandemic a PCR testing laboratory with a cooperative character was founded in spring 2021 to screen for SARS-CoV-2 in the Nuremberg region, Germany. The aim was to detect asymptomatic infections in day care facilities for children, schools, and companies. The laboratory used an established RT-PCR protocol and analyzed approximately 18,500 pools of up to 25 pooled samples each from gargles or swabs ("lollipops") from up to 135 facilities between July 2021 and June 2022. Usually, the participating facilities were informed about positive pools within a few hours. Retention samples from positive pools were usually analyzed on the same day, and the results were reported to the facilities as well as the German Electronic Reporting and Information System (DEMIS). In the laboratory results, both the local incidences and the transition from the Delta- to the Omicron surge in early 2022 were well reflected. It is plausible that about 4,800 secondary infections could be prevented from the approximately 1,570 positive individual samples detected in conjunction with appropriate isolation measures. Such a PCR laboratory, which is characterized by short response times and high flexibility, can thus provide valuable services for regional surveillance of infection incidence.
Als ein wichtiger Baustein zur regionalen Eindämmung der COVID-19 Pandemie wurde im Frühjahr 2021 ein PCR-Testlabor mit genossenschaftlichem Charakter zum Screening auf SARS-CoV-2 in der Region Nürnberger Land gegründet. Ziel war die Detektion asymptomatischer Infektionen in Kindertagesstätten, Schulen und Unternehmen. Das Labor nutzte ein etabliertes RT-PCR Verfahren und analysierte zwischen Juli 2021 und Juni 2022 aus bis zu 135 Einrichtungen rund 18.500 Pools mit je bis zu 25 vereinigten Proben aus Gurgelaten bzw. Abstrichtupfern („Lollis“). In der Regel wurden die teilnehmenden Einrichtungen innerhalb weniger Stunden über positive Pools informiert, Rückstellproben positiver Pools wurden meist noch am selben Tag analysiert und die Ergebnisse an die Einrichtungen sowie das Deutsche Elektronische Melde- und Informationssystem (DEMIS) gemeldet. In den Laborergebnissen bildeten sich über den Zeitraum Juli 2021 bis Juni 2022 sowohl die lokalen Inzidenzen als auch der Übergang von der Delta- zur Omikron-Welle Anfang 2022 gut ab. Es ist plausibel, dass sich bei den ca. 1.570 detektierten positiven Einzelproben in Verbindung mit geeigneten Isolationsmaßnahmen etwa 4.800 Sekundärinfektionen verhindern ließen. Ein solches PCR-Labor, das sich durch kurze Antwortzeiten und hohe Flexibilität auszeichnet, kann somit wertvolle Dienste für die regionale Überwachung des Infektionsgeschehens leisten.
Keywords: COVID-19; PCR test laboratory; SARS-CoV-2; coronavirus; pool testing.
Copyright © 2022 Bertram et al.