Objective: The main objective of the present study is to assess the sensitivity and specificity of a retrospective diagnostic of lymphatic tuberculosis (LTB), testing frozen samples using gene amplification PCR methods. The secondary objective was to compare the results of two different commercial tuberculosis gene amplification methods for this purpose.
Methods: We retrospectively studied 38 frozen samples, previously processed for mycobacterial culture between January 2014 and August 2019. The results of the previous cultures were: 21 samples positive for Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) (5 being smear positive), 7 samples culture positive for Mycobacterium avium-intracellulare complex and 10 samples which were mycobacterial culture negative and discarded for LTB diagnosis, used as controls. The samples were processed using two gene amplification methods: Xpert® MTB/RIF Ultra (Cepheid) and Abbott RealTime MTB Assay (Abbott).
Results: Compared to initial culture results the sensitivity and specificity of Xpert® MTB/RIF Ultra were 57.1% and 100% and 52.3 % and 92.5%, respectively for the Abbott RealTime MTB assay. The differences were not statiscally significant. In addition, there were no differences according to the period of freezing.
Conclusions: Gene amplification of frozen samples confirmed the diagnosis of lymphatic TB in almost 60% of cases, allowing retrospective diagnosis in initially non suspected cases. Both gene amplification techniques tested were equally useful.
Objetivos: El principal objetivo del presente estudio es establecer la sensibilidad y especificidad del diagnóstico retrospectivo de tuberculosis linfática (LTB), analizando muestras congeladas y utilizando métodos de amplificación genética basados en PCR. El objetivo secundario es comparar los resultados de dos métodos comercializados de amplificación genética de tuberculosis.
Material y métodos: Se estudiaron retrospectivamente 38 muestras congeladas, que previamente habían sido procesadas para realizar cultivo de micobacterias, entre enero de 2014 y agosto de 2019. Los resultados en ese momento fueron: 21 muestras positivas para Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) (de las que 5 tenían la tinción positiva), 7 muestras con cultivo positivo para Mycobacterium aviumintracellulare complex y 10 muestras con cultivo de micobacterias negativo, en las que se había descartado el diagnóstico de LTB, que se usaron como controles. Las muestras se procesaron utilizando dos métodos de amplificación genética: Xpert® MTB/RIF Ultra (Cepheid) y Abbott RealTime MTB Assay (Abbott).
Resultados: Comparando con los resultados de los cultivos iniciales, la sensibilidad y especificidad de Xpert® MTB/ RIF Ultra fueron de 57,1% y 100%, y de 52,3% y 92,5%, para Abbott RealTime MTB assay. Las diferencias no fueron estadísticamente significativas. Tampoco se observaron diferencias en relación al periodo transcurrido desde la congelación.
Conclusiones: La amplificación genética de muestras congeladas confirma el diagnóstico de tuberculosis linfática en casi el 60% de los casos, permitiendo el diagnóstico retrospectivo de casos no sospechados. Las dos técnicas de amplificación analizadas demostraron la misma utilidad.
Keywords: Abbott RealTime MTB; Frozen samples; Xpert ULTRA; diagnosis; extrapulmonary tuberculosis; lymph nodes.
©The Author 2021. Published by Sociedad Española de Quimioterapia. This article is distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/).