Xpert® MTB/RIF assay testing on stool for the diagnosis of paediatric pulmonary TB in Tanzania

Public Health Action. 2021 Jun 21;11(2):75-79. doi: 10.5588/pha.20.0062.

Abstract

Setting: Six health facilities in Dar es Salaam, Tanzania.

Objective: To evaluate the use of stool specimens in the diagnostic workup of paediatric TB using the Xpert® MTB/RIF assay.

Design: Between December 2018 and May 2019, we performed a cross-sectional diagnostic study of children aged between 1 month and 14 years with presumptive TB. A single stool specimen was tested using Xpert. The result was compared with the reference microbiological standard for respiratory or gastric specimens tested using Xpert and/or solid culture. The sensitivity, specificity and predictive values of stool Xpert assay were assessed.

Results: A total of 225 children with a median age of 2.17 years (IQR 1.16-5.19) were enrolled; 165/225 (73.3%) were aged <5 years. Of 225 children, 8 (3.6%) were diagnosed with TB as they were culture- or Xpert-positive on sputum/gastric aspirate. The stool Xpert assay showed a sensitivity of 62.5% (95% CI 25-92) and specificity of 100% (95% CI 98-100) against the reference standard.

Conclusion: Use of the Xpert assay on stool specimens had a moderate sensitivity and high specificity in the diagnosis of pulmonary TB in children. Our data adds to the body of evidence for the use of Xpert assay on stool as a non-respiratory specimen to complement conventional methods used to diagnose the disease.

Contexte: Six structures de santé à Dar es Salaam, Tanzanie.

Objectif: Evaluer l’utilisation d’échantillons de selles dans le bilan diagnostique de la TB pédiatrique en utilisant le test Xpert® MTB/RIF.

Schéma: Entre décembre 2018 et mai 2019, nous avons réalisé une étude transversale de bilans d’enfants âgés d’un mois à 14 ans avec la TB présumée. Un échantillon unique de selles a été testé par l’Xpert. Le résultat a été comparé avec comme référence le standard microbiologique d’échantillons respiratoires ou gastriques testés par test Xpert et/ou culture solide. La sensibilité, la spécificité et les valeurs prédictives de l’Xpert sur les selles ont été évaluées.

Résultats: Ont été enrôlés 225 enfants d’âge médiane 2,17 ans (IQR 1,16–5,19) dont 165 (73,3%) avaient moins de cinq ans. Huit (3,6%) enfants ont eu un diagnostic de TB par culture ou test Xpert positif sur aspiration de crachats/gastrique. Le test Xpert sur les selles a montré une sensibilité de 62,5% (IQR 25–92) et une spécificité de 100% (IQR 98–100) vis-à-vis du standard de référence.

Conclusion: Le recours au test Xpert sur des échantillons de selles a montré une sensibilité modérée et une spécificité élevée dans le diagnostic de la TB pulmonaire des enfants. Nous données confirment l’intérêt de l’utilisation du test Xpert sur les selles comme échantillon non respiratoire pour compléter les méthodes conventionnelles de diagnostic de la maladie.

Keywords: Xpert® MTB/RIF; diagnosis; paediatric TB; stool; tuberculosis.