Objective: Cystic echinococcosis (CE) is a zoonotic infection that affects humans, livestock and wild animals through the larval form of Echinococcus granulosus sensu lato (s.l.). Molecular and taxonomic studies carried out in the recent years accept that Echinococcus granulosus s.l., a complex of 5 cryptic species, causes CE. In this study, we performed morphological and molecular characterisation of cyst isolates obtained from a wild boar and mule naturally infected with hydatid cyst.
Methods: After gDNA isolation, the mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1 (mt-CO1) gene region was amplified by polymerase chain reaction (PCR) with specific primers. The amplified mt-CO1 PCR products were purified and one-way DNA sequence analysis was performed.
Results: Comparison of the partial sequences of mt-CO1 gene from the hydatid cyst isolates with that of reference sequences in GenBank revealed 100% similarity with E. granulosus sensu stricto (G1-G3) sequences.
Conclusion: To the best of our knowledge, this is the first study to determine the molecular characterisation of Echinococcus species in a wild boar in Turkey.
Amaç: Kistik ekinokokkozis (KE), Echinococcus granulosus sensu lato’nun (s.I.) larval formu tarafından oluşturulan; insanları, çiftlik hayvanları ve yaban hayvanlarını etkileyen zoonoz karakterli bir enfeksiyondur. Son yıllarda yapılan moleküler ve taksonomik çalışmalar neticesinde, KE’ye beş kriptik türün bir kompleksi olan Echinococcus granulosus s.l.’nun yol açtığı kabul edilmiştir. Bu çalışmada, hidatid kist ile doğal enfekte bir yaban domuzu ve bir katırdan elde edilen kist materyallerinin morfolojik ve moleküler karakterizasyonları yapılmıştır. Yöntemler: gDNA izolasyonundan sonra spesifik primerler kullanılarak, mitokondrial sitokrom oksidaz subunit 1 (mt-CO1) gen bölgesi polimeraz zincir reaksiyon (PZR) ile çoğaltılmıştır. Amplifiye olan mt-CO1 PZR ürünleri saflaştırılıp, tek yönlü DNA dizi analizi gerçekleştirilmiştir. Bulgular: GenBank’taki referans sekanslar ile kıyaslanması sonucunda, hidatid kist izolatlarının mt-CO1 gen bölgesi kısmi sekanslarının E. granulosus sensu stricto (G1-G3) sekanslarıyla %100 benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışma, Türkiye’de yaban domuzlarında Echinococcus türlerinin moleküler karakterizasyonunun belirlenmesine yönelik yapılmış ilk çalışmadır. Anahtar Kelimeler: Echinococcus granulosus, hidatid kist, katır, yaban domuzu, PZR, genotip.
Keywords: Echinococcus granulosus; hydatid cyst; mule; wild boar; PCR; genotype.