A rare splice site mutation in the gene encoding glucokinase/hexokinase 4 in a patient with MODY type 2

Vavilovskii Zhurnal Genet Selektsii. 2020 May;24(3):299-305. doi: 10.18699/VJ20.41-o.

Abstract

The article presents a variant of maturity onset diabetes of the young type 2, caused by a rare mutation in the GCK gene. Maturity onset diabetes of the young (MODY) is a hereditary form of diabetes with an autosomal dominant type of inheritance, an onset at a young age, and a primary defect in pancreatic β-cell function. This type of diabetes is different from classical types of diabetes mellitus (DM1 and DM2) in its clinical course, treatment strategies, and prognosis. Clinical manifestations of MODY are heterogeneous and may vary even among members of the same family, i. e., carriers of identical mutations. This phenotypic variation is due to the interaction of mutations with different genetic backgrounds and the influence of environmental factors (e. g., lifestyle). Using next-generation sequencing technology, the c.580-1G>A substitution (IVS5 -1G>A, rs1554335421) located in an acceptor splice site of intron 5 of the GCK gene was found in a proband. The identified variant cosegregated with a pathological phenotype in the examined family members. The GCK gene encodes glucokinase (hexokinase 4), which catalyzes the first step in a large number of glucose metabolic pathways such as glycolysis. Mutations in this gene are the cause of MODY2. The illness is characterized by an insignificant increase in the fasting glucose level, is a well-controlled disease without medication, and has a low prevalence of micro- and macrovascular complications of diabetes. The presented case of MODY2 reveals the clinical significance of a mutation in the splice site of the GCK gene. When nonclassical diabetes mellitus is being diagnosed in young people and pregnant women, genetic testing is needed to verify the diagnosis and to select the optimal treatment method. Key words: human; maturity onset diabetes of the young; MODY2; glucokinase gene; next-generation sequencing; genetic analysis; bioinformatics.

В статье рассмотрен вариант развития моногенной формы сахарного диабета (MODY), обуслов- ленный редкой мутацией в гене GCK. Диабет MODY представляет собой сахарный диабет с аутосомно-доми- нантным типом наследования, возникающий в молодом возрасте и проявляющийся в дисфункции β-клеток поджелудочной железы. Этот тип отличается от классических типов сахарного диабета (СД1, СД2) клиниче- ским течением, тактикой лечения и прогнозом для пациента. Клинические проявления MODY гетерогенны и могут различаться даже у представителей одной семьи, носителей одинаковых мутаций. Это обусловлено как сочетанием мутаций в различных генах у индивидуума, так и воздействием внешних факторов. Методом секвенирования нового поколения у пробанда была идентифицирована замена c.580 –1G>A (IVS5 –1G>A, rs1554335421), локализующаяся в акцепторном сайте сплайсинга пятого интрона гена GCK. Обнаруженный вариант сегрегировал с патологическим фенотипом у обследованных членов семьи. Ген GCK кодирует глюко- киназу (гексокиназу 4), которая катализирует первый шаг в различных путях метаболизма глюкозы. Мутации в этом гене ассоциированы с сахарным диабетом взрослого типа у молодых, подтип 2 (MODY2). Заболевание характеризуется незначительным повышением глюкозы натощак, хорошо контролируется медикамента- ми и отличается низкой распространенностью микро- и макрососудистых осложнений. Представленный в исследовании случай MODY2 выявил клиническую значимость мутации в сайте сплайсинга гена GCK. При возникновении у молодых людей и беременных женщин неклассического сахарного диабета проведение генетического тестирования необходимо для подтверждения диагноза и оптимального выбора тактики и способа лечения.

Keywords: MODY2; bioinformatics.; genetic analysis; glucokinase gene; human; maturity onset diabetes of the young; next-generation sequencing.