Objective: Our aim was to analyse the association with multiple sclerosis of the genetic markers of autoimmune disorders identified in genome-wide association studies in ethnically homogenous groups of Russians and Tatars residing in the Republic of Bashkortostan.
Material and methods: We performed genotyping of the genetic variants rs2069762 in IL2 gene, rs759648 in PVT1 gene, rs1800682 in FAS gene and rs12708716 in CLEC16A gene in the study group consisting of 1724 people (547 patients with multiple sclerosis, 1177 representatives of the control group). We analysed the association of the studied genetic markers with multiple sclerosis using logistic regression under additive genetic model implemented in PLINK program with sex a covariate.
Results: In the group of Tatars, we detected an association of PVT1 rs759648*Callele with multiple sclerosis (OR=1.42, p=0,023). Meta-analysis of the study results in the two ethnic groups we confirmed the association of the PVT1 rs759648*C allele with the disease (random effects model and fixed effect model: OR=1.29, p=0,018).
Conclusion: Our results provide an evidence of an association between multiple sclerosis and the PVT1 rs759648 allele in the populations of Russian and Tatars from the Republic of Bashkortostan. No association with any other studied polymorphic variant was found in the two ethnic groups.
Цель исследования: Проведение репликативного анализа ассоциаций с рассеянным склерозом генетических маркеров аутоиммунных заболеваний, выявленных в результате полногеномных ассоциативных исследований, в этнически гомогенных группах русских и татар, проживающих в Республике Башкортостан.
Материал и методы: В группе из 1724 человек (547 пациентов с рассеянным склерозом, 1177 представителей контрольной группы) проведено генотипирование с использованием метода аллель-специфичной ПЦР и ПЦР с анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов по полиморфным вариантам rs2069762 гена IL2, rs759648 гена PVT1, rs1800682 гена FAS и rs12708716 гена CLEC16A. Анализ ассоциаций изученных генетических маркеров с рассеянным склерозом проводили в программе PLINK методом логистической регрессии с применением аддитивной генетической модели, используя пол в качестве ковариаты.
Результаты: В группе татар нами найдена ассоциация аллеля PVT1 rs759648*С с рассеянным склерозом (OR=1,42, p=0,023). При проведении метаанализа результатов исследования в двух этнических группах была подтверждена ассоциация аллеля PVT1 rs759648*С с заболеванием (модель со случайными эффектами и модель фиксированного эффекта: OR=1,29, p=0,018).
Заключение: Полученные нами данные свидетельствуют о наличии ассоциации между полиморфным вариантом PVT1 rs759648 и рассеянным склерозом в популяции русских и татар, проживающих в Республике Башкортостан. Ассоциации с другими изученными полиморфными вариантами в двух исследуемых этнических группах не выявлены.
Keywords: analysis of association; gene polymorphism; genome-wide association studies; multiple sclerosis.