[Aerobic bacteria from skin lesions in reptiles and their antimicrobial susceptibility]

Tierarztl Prax Ausg K Kleintiere Heimtiere. 2020 Apr;48(2):78-88. doi: 10.1055/a-1115-7907. Epub 2020 Apr 23.
[Article in German]

Abstract

Objective: Bacterial skin infections are common in reptiles. Although many such infections are influenced by multifactorial problems, specific treatment of bacterial infections is an important consideration. The objective of this study was to evaluate the range of aerobic bacteria in skin lesions of reptiles and to determine their antimicrobial susceptibility.

Material and methods: Swabs of skin lesions from 219 reptiles were cultured for aerobic bacteria between January 2017 and June 2018. Isolates were identified based on growth on selective agar plates, biochemical parameters, as well as MALDI-TOF MS. Antibiotic susceptibility testing was carried out using the microdilution method.

Results: A total of 306 isolates were identified, mostly gram-negative, including Pseudomonas spp. (n = 48), Citrobacter spp. (n = 31, only in chelonians), aerobic spore-forming bacteria (n = 30), Aeromonas spp. (n = 20), Acinetobacter spp. (n = 20), Proteus spp. (n = 15), Staphylococcus spp. (n = 15), Klebsiella spp. (n = 13), Enterococcus spp. (n = 13), Morganella spp. (n = 11) as well as 78 other gram-negative and 12 other gram-positive bacteria. Colonization with 2 (n = 80) or more (n = 16) bacterial isolates was seen in 96 animals. Antibiotic susceptibility testing was carried out with 208 of the 306 isolated bacteria. Many isolates were sensitive (minimal inhibitory concentration [MIC] in µg/ml ≤ breakpoint) to enro- (E) and marbofloxacin (M): 86.4 % MIC ≤ 0.5 (E) and 95.5 % MIC ≤ 1 (M) for Pseudomonas spp., 86.4 % MIC ≤ 0.5 (E) and 90.9 % MIC ≤ 1 (M) for Citrobacter spp., 75.0 % MIC ≤ 0.5 (E) and 100 % MIC ≤ 1 (M) for Aeromonas spp. Trimethoprim/sulfamethoxazol proved to be effective against most of the Citrobacter spp. (90.9 % MIC ≤ 2/38) and Aeromonas spp. (75.0 % MIC ≤ 2/38). Amikacin was effective against nearly all Pseudomonas spp. (97.7 % MIC ≤ 16), Citrobacter spp. (95.5 % MIC ≤ 16) and Aeromonas spp. (93.8 % MIC ≤ 16).

Conclusion and clinical relevance: The majority of isolates were gram-negative; the clinical relevance of individual isolates must, however, be evaluated on a case by case basis. Many of the isolated bacteria were sensitive to fluoroquinolones as well as aminoglycosides. Susceptibility testing is recommended since use of these antibiotics should be limited and for every tested group of antibiotics resistant isolates were found.

Gegenstand und ziel: Bakterielle Hautinfektionen kommen bei Reptilien häufig vor. Obwohl viele dieser Infektionen durch multifaktorielle Probleme verursacht werden, ist eine spezifische Behandlung nötig. Ziel der Studie war, das Keimspektrum und die Resistenzlage von aeroben Bakterien in Hautläsionen von Reptilien zu untersuchen.

Material und methoden: Tupferproben dermaler Läsionen von 219 Reptilien wurden bakteriologisch untersucht (01/2017–06/2018). Die Identifizierung der Bakterien erfolgte anhand von Selektivnährböden, biochemischen Parametern sowie MALDI-TOF-MS, die Erstellung der Antibiogramme mittels Mikrodilutionsmethode.

Ergebnisse: Bei den insgesamt identifizierten 306 Keimisolaten handelte es sich überwiegend um gramnegative Spezies. Pseudomonas spp. (n = 48), Citrobacter spp. (n = 31, nur bei Schildkröten), aerobe Sporenbildner (n = 30), Aeromonas spp. (n = 20), Acinetobacter spp. (n = 20), Proteus spp. (n = 15), Staphylococcus spp. (n = 15), Klebsiella spp. (n = 13), Enterococcus spp. (n = 13) sowie Morganella spp. (n = 11) machten den Hauptteil aus, daneben konnten weitere gramnegative (n = 78) und grampositive (n = 12) Bakterienspezies identifiziert werden. Mischkulturen mit 2 (n = 80) oder mehr (n = 16) Keimen traten bei 96 Tieren auf. Von 208 der 306 Isolate wurden Antibiogramme erstellt. Gegenüber Enro- (E) und Marbofloxacin (M) waren viele Isolate sensibel (minimale Hemmkonzentration [MHK] in µg/ml ≤ Grenzwert), beispielsweise Pseudomonas spp. (E: 86,4 % MHK ≤ 0,5; M: 95,5 % MHK ≤ 1), Citrobacter spp. (E: 86,4 % MHK ≤ 0,5; M: 90,9 % MHK ≤ 1) und Aeromonas spp. (E: 75,0 % MHK ≤ 0,5; M: 100 % MHK ≤ 1). Trimethoprim/Sulfamethoxazol erwies sich als wirksam gegen die meisten Citrobacter- (90,9 % MHK ≤ 2/38) und Aeromonas- (75,0 % MHK ≤ 2/38) Isolate. Amikacin war wirksam gegen fast alle Pseudomonas spp. (97,7 % MHK ≤ 16), Citrobacter spp. (95,5 % MHK ≤ 16) sowie Aeromonas spp. (93,8 % MHK ≤ 16).

Schlussfolgerung und klinische relevanz: Das Keimspektrum von Reptilienhautläsionen umfasst vor allem gramnegative Bakterien, deren klinische Relevanz für jeden Einzelfall abzuwägen ist. Viele Isolate dieser Studie waren sensibel für Fluorchinolone sowie Aminoglykoside. Da der Einsatz dieser Antibiotika zurückhaltend erfolgen sollte und gegenüber jeder getesteten Antibiotikagruppe auch resistente Isolate identifiziert wurden, wird eine Antibiogrammerstellung empfohlen.

MeSH terms

  • Animals
  • Anti-Bacterial Agents / pharmacology*
  • Bacteria, Aerobic / classification
  • Bacteria, Aerobic / drug effects*
  • Bacteria, Aerobic / isolation & purification
  • Bacterial Infections* / microbiology
  • Bacterial Infections* / veterinary
  • Microbial Sensitivity Tests
  • Pets / microbiology*
  • Reptiles / microbiology*

Substances

  • Anti-Bacterial Agents