During 2015, duck farms (n = 27) in Sharkia Province, Egypt, experienced several disease outbreaks leading to mortality and nervous manifestations. Upon necropsy, the affected ducklings showed liver lesions, such as hemorrhage or necrosis, suggestive of duck virus hepatitis (DVH). Reverse transcription-PCR (RT-PCR), on the basis of the 3D gene, found duck livers from 21 farms to be positive for duck hepatitis A virus serotype 1 (DHAV-1). All duck breeds (Pekin, Mallard, and Muscovy) were infected. The virus was isolated in embryonated chicken eggs, which showed embryonic mortality (40%-80%) within 5-7 days, stunting or dwarfing (69.6%), and necrotic liver foci (60.9%). The VP1 gene of 11 DHAV-1 strains was characterized by RT-PCR and Sanger sequencing. All study strains were clustered in a monophyletic branch within subclade B2 of Group 4 and were separated from the Egyptian vaccine strain. Several amino acid (aa) residues, such as V129, S142 (only in four strains), L181, G184, and K217, were related to virus attenuation. However, two aa residues (N193 and E205), found in virulent DHAV-1 strains, were also observed in our strains. This study confirms the circulation of DHAV-1 (subclade B2) in Lower Egypt and elucidates the phylogenetic characters of the VP1 genes, which will be useful in following the local trends of DHAV-1 infections. Further studies are indicated to determine the correlation between these mutations and the virulence of the Egyptian DHAV-1 isolates.
Brotes de virus de la hepatitis A del pato en parvadas de patitos en Egipto. Durante el año 2015, granjas de patos (n = 27) en la provincia de Sharkia en Egipto, experimentaron varios brotes de enfermedades que causaron mortalidad y manifestaciones nerviosas. Durante la necropsia, los patitos afectados mostraron lesiones hepáticas, como necrosis, hemorragia o ambas, sugestivas de la hepatitis viral del pato (con las siglas en inglés DVH). Un método de transcripción reversa y PCR (RT-PCR), sobre la base del gene 3D, encontró que los hígados de pato de 21 granjas eran positivos para el serotipo 1 del virus de la hepatitis A de pato (DHAV-1). Todas las razas de patos (Pekin, mallard y pato real) se infectaron. El virus se aisló en huevos de gallina embrionados, que mostraron una mortalidad embrionaria (40% -80%) en cinco a siete días, retraso del crecimiento o enanismo (69.6%) y focos hepáticos necróticos (60.9%). El gene VP1 de 11 cepas de DHAV-1 se caracterizó por RT-PCR y secuenciación por el método de Sanger. Todas las cepas del estudio se agruparon en una rama monofilética en el subclado B2 dentro del Grupo 4 y se separaron de la cepa de la vacuna egipcia. Varios residuos de aminoácidos, como V129, S142 (solo en cuatro cepas), L181, G184 y K217, se relacionaron con la atenuación del virus. Sin embargo, dos residuos de aminoácidos (N193 y E205), encontrados en cepas virulentas de DHAV-1, se observaron en las cepas descritas en este estudio. Este estudio confirma la circulación del virus de la hepatitis A del pato DHAV-1 (subclado B2) en el Bajo Egipto y aclara las características filogenéticas de los genes VP1, que serán útiles para seguir las tendencias locales de las infecciones por este virus. Se indican estudios adicionales para determinar la correlación entre estas mutaciones y la virulencia de los aislamientos egipcios del virus de la hepatitis A del pato.
Keywords: RT-PCR; VP1; duck; hepatitis; phylogenesis; picornavirus; sequencing.