While the incidence of cholera is decreasing in Haiti, the time required to render stool culture results with antibiogram using the standard method practiced at the National Public Health Laboratory (LNSP) remains at an average of 80 hours. This delay can be further lengthened by the process of rendering the analysis reports to the sites of care which significantly delays the community responses to cholera. Through this study, we have aimed to assess the reliability of partial results. We have studied 250 stool samples that were analyzed between January and September 2017 at the LNSP by determining the specificity, positive predictive value and positive likelihood ratio of i) the identification of yellowish colonies and ii) the identification of yellowish colonies with a positive oxidase assay in comparison to the stool culture. Compared to the entire process, the identification of yellowish colonies showed a specificity of 56%, a positive predictive value of 69% and a positive likelihood ratio of 2.27. The identification of yellowish colonies with a positive oxidase assay showed a specificity of 77%, a positive predictive value of 81% and a positive likelihood ratio of 4.31. The communication of partial results at these steps would likely guide community interventions despite a relative decrease in reliability of the results.
Le temps nécessaire au rendu des résultats de culture des selles avec antibiogramme par la méthode classique pratiquée au Laboratoire national de santé publique (LNSP) d’Haïti s’étale sur une durée de 80 heures en moyenne. Ce délai peut être encore allongé par le processus de rendu des rapports d’analyse aux sites de prise en charge, ce qui retarde de manière significative les réponses communautaires face au choléra. Cette étude vise à évaluer la fiabilité de résultats partiels par rapport au processus complet. Nous avons inclus 250 échantillons de selles analysés au LNSP de janvier à septembre 2017 en déterminant la spécificité, la valeur prédictive positive et le rapport de vraisemblance positif de l’identification des colonies jaunâtres et de l’identification des colonies jaunâtres oxydase positive. Par rapport au processus complet de culture des selles, l’identification des colonies jaunâtres a montré une spécificité de 56 %, une valeur prédictive positive de 69 % et un rapport de vraisemblance positif de 2,27. Quant à l’identification des colonies jaunâtres oxydase positive, la spécificité est de 77 %, la valeur prédictive positive de 81 % et le rapport de vraisemblance positif de 4,31. La communication de résultats partiels aux équipes de terrain à ces étapes serait utile pour guider les interventions en dépit d’une relative diminution de leur fiabilité par rapport au gold standard.
Keywords: Artibonite; Centre Department; Cholera; Community response; Culture; Diagnosis test; Greater Antilles; Haiti; Laboratory; Ouest Department; Sud Department; Sud-Est Department.