Characterization of influenza outbreaks in Lebanon during the 2013/14 and 2014/15 seasons

East Mediterr Health J. 2016 Oct 2;22(7):547-551.

Abstract

Despite the significant burden of influenza outbreaks, active disease monitoring has been largely absent in the Middle East, including Lebanon. In this study we characterized influenza virus in 440 nasopharyngeal swabs collected from patients with acute respiratory infections during two influenza seasons in Lebanon. Influenza A(H3N2) was dominant in the 2013/14 season while the A(H1N1)pdm09 and B/Yamagata strains were most prevalent in the 2014/15 season. All tested isolates were susceptible to 4 neuraminidase inhibitors (oseltamivir, zanamivir, peramivir and laninamivir). Genetic analysis of the haemagglutinin gene revealed multiple introductions of influenza viruses into Lebanon from different geographic sources during each season. Additionally, large data gaps were identified in the Middle East region, as indicated by the lack of current influenza sequences in the database from many countries in the region.

تحديد خصائص أوبئة الإنفلونزا في لبنان خلال موسمَي 2014/2013 و 2015/2014.

ريكو سايتو، هيبينو آكينوبو، ربى شاكر، عاد عاقل، آية عساف كاسالس، مراي لطيف، تاكاشي أداغري، ريوسك إنابة، نادية سوداني، سارة خفاجة، سهى غانم، مريم رجب، يوغو شبوغوا، غسان. دبيبو، حسن زراقت.

عى الرغم من العبء الكبر لأوبئة الإنفلونزا عى الصحة العامة لم تكن هناك مراقبة فعالة للمرض حتى وقت قريب في الرق الأوسط، با فيه لبنان. وقد قمنا في هذه الدراسة بتحديد خصائص فروس الإنفلونزا في 440 مسحة أنفية بلعومية جُعت من مرضى مصابن بأمراض تنفسية حادة أثناء موسمين من مواسم الإنفلونزا في لبنان. فكان فروس إنفلونزا A(H3N2) سائداً في موسم 2014/2013 بينا كانت سالات A(H1N1)pdm09 وياماجاتا الأكثر انتشاراً في موسم 2015/2014. وكانت جميع العزلات حساسة لأربعة من مثبطات النورامينيداز (أوسيلتاميفير، وزاناميفر، وبيراميفر، ولانيناميفر). وكشف التحليل الجيني لجن الهيماجلوتبنن إدخالات متعددة لفيروسات الإنفلونزا إلى لبنان من مصادر جغرافية مختلفة أثناء كل موسم. بالإضافة إلى ذلك تم التعرف عى وجود ثغرات كبرة في البيانات في إقليم الرق الأوسط، كا دل عى ذلك عدم وجود متواليات الإنفلونزا الحالية في قواعد بيانات العديد من بلدان الإقليم.

Caractérisation des flambées de grippe au Liban lors des saisons 2013/2014 et 2014/2015.

Malgré la lourde charge que représentent les flambées de grippe, la surveillance active de la maladie était jusqu’à présent inexistante au Moyen-Orient, et notamment au Liban. Dans la présente étude, le virus de la grippe a été caractérisé dans 440 sécrétions rhinopharyngées prélevées par écouvillonnage chez des patients ayant souffert d’infections respiratoires aiguës pendant deux saisons grippales au Liban. Le virus de la grippe A(H3N2) était prédominant pendant la saison 2013/2014, tandis que celui de la grippe A(H1N1)pdm09 et les souches de grippe B/Yamagata étaient les plus courants pendant la saison 2014/2015. Tous les isolats testés étaient sensibles à quatre inhibiteurs de la neuraminidase (l’oseltamivir, le zanamivir, le peramivir, et le laninamivir). L’analyse génétique du gène de l’hémagglutinine a révélé de multiples introductions des virus de la grippe au Liban, depuis différentes sources géographiques au cours de chaque saison. De plus, d’importantes lacunes dans les données ont été constatées dans la région du Moyen-Orient, comme le montre l’absence des séquences génétiques actuelles de la grippe dans les bases de données de nombreux pays de la région.

MeSH terms

  • Disease Outbreaks*
  • Humans
  • Influenza A Virus, H1N1 Subtype / isolation & purification
  • Influenza A Virus, H3N2 Subtype / isolation & purification
  • Influenza, Human / epidemiology*
  • Lebanon / epidemiology
  • Seasons*