Influenza virus positivity and circulating subtypes among cases of influenza-like illness and severe acute respiratory infection, Egypt, 2012-2015

East Mediterr Health J. 2016 Oct 2;22(7):527-536.

Abstract

Information on the prevalence of influenza, circulating virus subtypes and seasonality is essential for selecting strains for annual vaccines and for planning immunization programmes. Data were obtained from the 13 sentinel surveillance sites throughout Egypt during 2012-2015. Laboratory-confirmed influenza was found in 13% of cases of influenza-like illness (ILI) and 18% of cases of severe acute respiratory infection (SARI); positivity for influenza was similar in cases of ILI and SARI in patients up to 15 years of age but increased for SARI and decreased for ILI in people aged ≥ 15 years. The most commonly observed influenza virus subtypes were B followed by A/ H3 in ILI cases, and A/H1N1 followed by B in SARI cases. The seasonality of influenza in ILI cases was November- February, and that in SARI cases was November-March, peaking in January.

إيجابية فيروسات الإنفلونزا والأنواع الفرعية الجوالة لدى حالات الأمراض الشبيهة بالإنفلونزا والأمراض التنفسية الحادة الوخيمة، مر، 2012-2015.

سمير رفاعى، مروة محمد أمين، منال لبيب، عمرو قنديل.

إن المعلومات المتعلقة بانتشار الإنفلونزا والأنواع الفرعية للفيروسات الجوالة وبالموسمية ضرورية لانتقاء السالات الخاصة باللقاحات السنوية وللتخطيط لبرامج التطعيم. لقد تم الحصول عى بيانات من مواقع الترصد ال 13 الموجودة في أرجاء مر، للفرة 2012-2015. فوُجد أن هناك إنفلونزا مؤكدة مختبرياً لدى % 13 من حالات الأمراض الشبيهة بالإنفلونزا و% 18 من حالات الأمراض التنفسية الحادة الوخيمة، وكانت الإيجابية للإنفلونزا متشابهة لدى حالات الأمراض الشبيهة بالإنفلونزا وحالات الأمراض التنفسية الحادة الوخيمة حتى سن ال 15 عاماً، لكنها ارتفعت في حالات الأمراض التنفسية الحادة الوخيمة وانخفضت في حالات الأمراض الشبيهة بالإنفلونزا لدى الأشخاص الذين كانت أعمارهم ≥ 15 سنة. ولوحظ أن الأنواع الفرعية لفروس الإنفلونزا الأكثر شيوعاً كانت B، تليها A/H3 في الأمراض الشبيهة بالإنفلونزا و A/H1N1، تليها B في حالات الأمراض التنفسية الحادة الوخيمة. وكانت موسمية الإنفلونزا في الحالات الشبيهة بالإنفلوانزا من نوفمبر/تشرين الثاني إلى فبراير/شباط ، وفي حالات الأمراض التنفسية الحادة الوخيمة كانت من نوفمبر/تشرين الثاني إلى مارس/آذار، وتبلغ ذروتها في يناير/كانون الثاني.

Égypte : positivité et sous-types circulants du virus de la grippe parmi les cas de syndrome de type grippal et d’infection respiratoire aiguë sévère, 2012-2015.

Les informations sur la prévalence de la grippe, les sous-types circulants du virus et la saisonnalité sont essentielles pour la sélection des souches destinées aux vaccins annuels, ainsi que pour la planification des programmes de vaccination. Les données sont issues des 13 sites sentinelles de surveillance à travers l’Égypte pour la période 2012-2015. La présence de la grippe a été confirmée en laboratoire pour 13 % des cas de syndrome de type grippal (STG) et 18 % des cas d’infection respiratoire aigüe sévère (IRAS) ; chez les personnes dont l'âge est inférieur ou égal à 15 ans, le taux de positivité pour la grippe était semblable pour les cas de STG et d’IRAS. Cependant, il augmentait pour les IRAS et diminuait pour le STG chez les personnes de 15 ans et plus. Les sous-types du virus de la grippe les plus fréquemment identifiés étaient le virus B suivi du A/H3 pour les cas de STG, et le virus A/H1N1 suivi du B pour les cas d’IRAS. La saisonnalité de la grippe s’étendait de novembre à février pour les cas de STG, et de novembre à mars, avec un pic en janvier, pour les cas d’IRAS.

Publication types

  • Review

MeSH terms

  • Adolescent
  • Adult
  • Aged
  • Child
  • Child, Preschool
  • Coronavirus Infections / epidemiology*
  • Egypt / epidemiology
  • Female
  • Humans
  • Infant
  • Influenza A Virus, H1N1 Subtype / isolation & purification*
  • Influenza A Virus, H5N1 Subtype / isolation & purification*
  • Influenza A virus / classification*
  • Influenza A virus / isolation & purification*
  • Influenza, Human / epidemiology*
  • Influenza, Human / virology*
  • Male
  • Middle Aged
  • Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus / isolation & purification*
  • Prevalence
  • Sentinel Surveillance
  • Severity of Illness Index
  • Young Adult