Aim: To analyze structural variations in the genome in children with autism and intellectual disability.
Material and methods: Using high-resolution karyotyping (AffymetrixCytoScan HD Array) and original bioinformatic technology, 200 children with autism and intellectual disability were studied.
Results and conclusion: Data on structural variations in the genome in children with autism and intellectual disability are provided. Causative genomic pathology (chromosome abnormalities and copy number variations - CNV) was determined in 97 cases (48.5%). Based on these
Results: 24 candidate genes for autism with intellectual disability were selected. In 16 cases (8%), the chromosome mosaicism manifested as aneuploidy of whole autosomes and sex chromosomes (gonosomes) was identified. In 87 children (43.5%), there were genomic variations, which are characteristic of the so-called «grey zone» of genetic pathology in mental illnesses. Bioinformatic analysis showed that these genomic variations had a pleiotropic effect on the phenotype.
Цель исследования. Изучение структурных вариаций генома у детей с аутизмом и умственной отсталостью. Материал и методы. Обследовали 200 детей с аутизмом и умственной отсталостью при помощи высокоразрешающего молекулярного кариотипирования (платформа Affymetrix CytoScan HD Array) и оригинальной биоинформатической технологии. Результаты и заключение. Приведены данные относительно структурных вариаций генома в изученных случаях. Геномная патология (хромосомные микроаномалии и вариации числа копий последовательностей ДНК - copy number variations) была ассоциирована с клиническими формами нарушения психики в 97 (48,5%) случаях из 200. Были определены 24 гена-кандидата аутизма, сочетанного с умственной отсталостью. В 16 (8%) случаях был выявлен хромосомный мозаицизм в виде анеуплоидии, затрагивающей полностью как аутосомы, так и половые хромосомы (гоносомы). У 87 (43,5%) детей наблюдались геномные вариации, характерные для так называемой 'серой зоны', включающие гены, функции которых до настоящего времени не определены. С помощью биоинформатического анализа нами показано, что в данных случаях вариации генома затрагивают гены, мутации в которых, видимо, могут иметь плейотропный эффект.