Permanent Draft Genome Sequence of Frankia sp. Strain Allo2, a Salt-Tolerant Nitrogen-Fixing Actinobacterium Isolated from the Root Nodules of Allocasuarina

Rediet Oshone; Mariama Ngom; Feseha Abebe-Akele; Stephen Simpson; Krystalynne Morris; Mame Ourèye Sy; Antony Champion; W Kelley Thomas; Louis S Tisa

doi:10.1128/genomeA.00388-16

Permanent Draft Genome Sequence of Frankia sp. Strain Allo2, a Salt-Tolerant Nitrogen-Fixing Actinobacterium Isolated from the Root Nodules of Allocasuarina

Genome Announc. 2016 May 19;4(3):e00388-16. doi: 10.1128/genomeA.00388-16.

Authors

Rediet Oshone¹, Mariama Ngom², Feseha Abebe-Akele¹, Stephen Simpson¹, Krystalynne Morris¹, Mame Ourèye Sy³, Antony Champion⁴, W Kelley Thomas¹, Louis S Tisa⁵

Affiliations

¹ University of New Hampshire, Durham, New Hampshire, USA.
² University of New Hampshire, Durham, New Hampshire, USA Laboratoire Mixte International Adaptation des Plantes et Microorganismes Associés aux Stress Environnementaux (LAPSE), Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal Département de Biologie Végétale, Laboratoire Campus de Biotechnologies Végétales, Faculté des Sciences et Techniques, Université Cheikh Anta Diop, Dakar-Fann, Sénégal Laboratoire Commun de Microbiologie IRD/ISRA/UCAD, Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal.
³ Laboratoire Mixte International Adaptation des Plantes et Microorganismes Associés aux Stress Environnementaux (LAPSE), Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal Département de Biologie Végétale, Laboratoire Campus de Biotechnologies Végétales, Faculté des Sciences et Techniques, Université Cheikh Anta Diop, Dakar-Fann, Sénégal.
⁴ Laboratoire Mixte International Adaptation des Plantes et Microorganismes Associés aux Stress Environnementaux (LAPSE), Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal Laboratoire Commun de Microbiologie IRD/ISRA/UCAD, Centre de Recherche de Bel Air, Dakar, Sénégal Institut de recherche pour le développement (IRD), UMR DIADE, Montpellier, France.
⁵ University of New Hampshire, Durham, New Hampshire, USA louis.tisa@unh.edu.

Abstract

Frankia sp. strain Allo2 is a member of Frankia lineage Ib, which is able to reinfect plants of the Casuarinaceae family, and exhibits a high level of salt tolerance compared to other isolates. Here, we report the 5.3-Mbp draft genome sequence of Frankia sp. strain Allo2 with a G+C content of 70.0% and 4,224 candidate protein-encoding genes.